Vliv iontů na interakce proteinu BRCA1 s DNA.

Bc. Kateřina WIELGUSOVÁ

Diplomová práce

Influence of ions on the protein BRCA1-DNA interactions.

Anotace:

BRCA1 je nádorový supresorový gen, jehož mutace jsou spojovány s výskytem karcinomů prsu a vaječníků. Produkt genu obsahuje ve své struktuře několik důležitých domén, díky kterým vykonává rozmanité funkce. Mezi nejdůležitější řadíme opravu poškozené DNA. BRCA1 se váže prioritně na jednořetězcové úseky DNA, nicméně byly objeveny vazby i na její jiné formy, například na superhelikální typ. V této práci byly vyizolovány konstrukty proteinu BRCA1, se kterými byla provedena vazba na superhelikální i lineární formu DNA. Vazba byla vizualizována pomocí gelové retardační elektroforézy. Konstrukty projevily svou vazebnou afinitu na obě použité formy DNA. Dále byl studován vliv iontů na vytváření komplexů BRCA1-DNA. Vznik vazby byl ovlivněn zejména ionty měďnatými, kademnatými a zinečnatými. Jednalo se o ovlivnění stimulační, kdy s rostoucí koncentrací použitých iontů byla vazba BRCA1-DNA stabilizována.

Abstract:

BRCA1 is a tumor suppressor gene whose mutations are associated with breast and ovarian cancers. Gene product contains several important domains in its structure through which protein performs multiple functions. One of the most important function is repairing of damaged DNA. BRCA1 binds preferentially to single stranded DNA, however, binding to other forms of DNA, such as supercoiled, was discovered. In this thesis constructs of BRCA1 protein were isolated and bound to supercoiled and linear DNA. Binding was visualized by electrophoretic mobility shift assay. Constructs binding affinity to both type of DNA was demonstrated. Furthermore, the influence of ions on the protein BRCA1-DNA interactions was studied. Bond formation was affected mainly by ions of cupric, cadmium and zinc. The influence was stimulating, with increasing concentrations of ions, BRCA1-DNA binding was stabilized.

Klíčová slova

BRCA1, nádorový supresor, vazba protein-DNA, EMSA, ionty

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 24. 4. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 23. 5. 2017
• Vedoucí: doc. RNDr. Petr Pečinka, Ph.D.

OSTRAVSKÁ UNIVERZITA

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie