Srovnávací analýza vlivu vybraných katabolitů tryptofanu na transkripční aktivitu AhR v myší a lidské hepatomové linii

Barbora PLECÁKOVÁ

Bachelor's thesis

Comparative analysis of tryptophan catabolites-elicited AHR activation in human and mouse hepatoma cell line

Abstract:

Aryl uhlovodíkový receptor (AhR) je ligandy aktivovaný transkripční faktor zodpovědný nejen za metabolismus xenobiotik, ale i za správnou funkci několika fyziologických procesů. Receptor je exprimován v mnoha tkáních jedinců několika živočišných druhů, a přestože jsou mezi organismy jeho struktura a funkce fylogeneticky vysoce konzervovány, dochází v případě některých látek k jeho druhově specifickému působení. V několika výzkumných pracích byly takové rozdíly již dříve zaznamenány mimo jiné i ve spojitosti s indolovými deriváty tryptofanu, které jsou schopny modulace aktivity AhR. Velké množství z nich jsou produkty mikrobiálního metabolismu této aminokyseliny a hrají tak důležitou roli v endogenní AhR signalizaci. Tato bakalářská práce se zaměřuje na srovnání vlivu vybraných katabolitů tryptofanu na transkripční aktivitu aryl uhlovodíkového receptoru v myší a lidské buněčné linii odvozené od hepatocelulárního karcinomu. Data získaná z experimentů prokázala druhově specifický účinek na aktivitu AhR u všech testovaných látek, přičemž nejvýraznější rozdíly byly pozorovány v jeho aktivaci látkami FICZ a indirubin. Tato práce tak poskytuje informace o rozdílné úrovni aktivace myšího a lidského AhR identickými látkami, které jsou důležitou znalostí pro vyhodnocení výsledků studií týkajících se tohoto receptoru.

Abstract:

Aryl hydrocarbon receptor is a ligand-dependent transcription factor responsible not only for the metabolism of xenobiotics, but also for the proper function of several physiological processes. The receptor is expressed in many tissues of individuals of several animal species and although its structure and function are highly conserved among organisms, it is species-specific in the case of certain substances. In several research works, such differences have been observed before, including in association with indole derivatives of tryptophan, which are capable of modulating AhR activity. Large numbers of these are products of the microbial metabolism of this amino acid and thus play an important role in endogenous AhR signalling. This Bachelor thesis focuses on comparing the effect of selected tryptophan catabolites on the transcription activity of the aryl hydrocarbon receptor in mice and human cell line derived from hepatocellular carcinoma. Data obtained from the experiments showed a species-specific effect on AhR activity across all substances tested, with the most pronounced differences observed in its activation by FICZ and indirubin. This work thus provides information about different levels of mouse and human AhR activation by identical substances, which is important knowledge for evaluating the results of the AhR studies.

Keywords

Aryl uhlovodíkový receptor, katabolity tryptofanu, druhové rozdíly, reporter gene assay

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 3. 5. 2024

Thesis defence

• Supervisor: Mgr. Aneta Vrzalová, Ph.D.

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Molecular and Cell Biology / Molecular and Cell Biology