Genetická variabilita prasete divokého ve vybraných lokalitách ČR

Bc. Luboš Novák

Diplomová práce

Genetic variability of Sus scrofa in selected areas of the Czech republic

Anotace:

V této práci byla zkoumána genetická struktura populace prasete divokého v určených lokalitách ČR. Mikrosatelitní analýza proběhla za použití 12 mikrosatelitních sekvencí s celkovým počtem 134 alel. Celkem bylo analyzováno 244 jedinců, kteří byli rozděleni podle lokalit do 24 subpopulací. Průměrný polymorfní informační obsah pro populaci prasete divokého v ČR byl odhadnut na 0,7014. Průměrná očekávaná a průměrná pozorovaná heterozygotnost celé populace dosahovala hodnot 0,6884, resp. 0,6955. Hardy-Weinbergova rovnováha byla potvrzena pouze u čtyř populací. Wrightovy statistiky potvrdily náhodnost křížení mezi subpopulacemi prasete divokého a zároveň určily minimální míru inbrední deprese. Bylo potvrzeno, že mezi subpopulacemi probíhá genový tok, zároveň bylo nastíněno, že dopravní infrastruktura ovlivňuje tok genů, který může následně probíhat na dlouhé vzdálenosti.

Abstract:

In this work, I studied the genetic structure of the wild boar (Sus scrofa) populations in different areas of the Czech Republic. Microsatellite analysis used in this work employed 12 different microsatellite sequences and accounted for the total of 134 alleles. Overall, 244 individuals have been analysed and these have been divided into subpopulations based on their location. Average polymorphism for the wild boar population of the Czech Republic has been estimated to be around 0,7014. Average expected and observed heterozygosities for this population have been 0,6884 and 0,6955, respectively. Hardy-Weinberg equilibrium has been confirmed solely for 4 subpopulations. Wright statistics confirmed random mating between subpopulations of the wild boar and have shown minimal levels of inbreeding depression. It has been confirmed that there is considerable gene flow between different subpopulations and that road infrastructure influences the gene flow, which can in turn occur over long distances.

Klíčová slova

mikrosatelitní analýza, STR, prase divoké, genetika populací, genetická variabilita

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 5. 2014

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 13. 6. 2014
• Vedoucí: Ing. Martin Ernst, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Experimentální biologie / Molekulární biologie a genetika