Charakterizace produktu genu Pden_3133 bakterie Paracoccus denitrificans

Bc. Marek Zvalo

Diplomová práce

Characterization of the product of the Paracoccus denitrificans Pden_3133 gene

Abstract:

Diploma thesis is focused on preparation and characterization of the product of gene 3133 from bacterium Paracoccus denitrificans. The gene 3133 codes an enzyme NADPH:FMN oxidoreductase. Kinetical parameters of the enzyme, mechanism of enzymatic reaction, dependency of enzyme activity on reaction conditions and covalent modification of amino acid groups by chemical reagents were measured. These measurements were made by using Warburg’s optical test. A putative amino acid sequence for the FMN binding site was determined.

Abstract:

Diplomová práce se zabývá přípravou a charakterizací produktu genu 3133 z baktérie Paracoccus denitrificans. Gen 3133 kóduje enzym NADPH:FMN oxidoreduktasu. U enzymu byly stanoveny kinetické parametry, mechanizmus reakce, závislost aktivity na podmínkách reakce a kovalentní modifikací aminokyselinových skupin enzymu chemickými činidly. Toto stanovení se dělalo pomocí Warburgova optického testu. Byla zjištěna sekvence aminokyselin, která je pravděpodobně součástí vazebného místa pro FMN.

Klíčová slova

gen 3133, FerB, Paracoccus denitrificans, ArsH, NADPH, FMN, enzym, Warburgov optický test, enzymová aktivita gene 3133, enzyme, Warburg’s optical test, enzyme activity

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 18. 5. 2015

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 2. 6. 2015
• Vedoucí: prof. RNDr. Igor Kučera, DrSc.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biochemie / Analytická biochemie