Aplikace pro zobrazování ligandů ve strukturách proteinů – Bc. Petr Potěšil
Bc. Petr Potěšil
Master's thesis
Aplikace pro zobrazování ligandů ve strukturách proteinů
Application for visualization of ligands in protein structures
Abstract:
Cílem diplomové práce bylo vytvořit aplikaci pro vizualizaci ligandů na strukturách proteinů. Ligandy jsou hledány na zadané proteinové struktuře a na strukturách podobných. Tyto struktury jsou získávány z PDB databáze. Výstupem aplikace je skript pro aplikaci PyMol, který zobrazí všechny nalezené ligandy, použité struktury a nejzajímavější residua. Součástí výstupu je také soubor se všemi zajímavými …moreAbstract:
The goal of this diploma thesis was to create an application for visualization of ligands in protein structures. Ligands are searched in the given protein structure and also in similar structures. These structures are obtained from PDB database. The output of this application is the PyMol script that displays all ligands, used structures and the most important residues. The output also contains file …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 9. 1. 2012
Identifier:
https://is.muni.cz/th/yixrh/
Thesis defence
- Date of defence: 8. 2. 2012
- Supervisor: RNDr. Antonín Pavelka, Ph.D.
- Reader: Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsMaster programme / field:
Informatics / Information Systems
Theses on a related topic
-
Proteinová krystalografie a studium interakce protein/ligand za pomoci NMR technik
David Buchta -
Quantum Mechanical Investigation of Non-Covalent Interaction in Protein-Ligand and Nanomaterial Complexes
Saltuk Mustafa EYRILMEZ -
Studium nekovalentních interakcí protein-ligand pomocí hmotnostní spektrometrie
Petra ZAPLETALOVÁ -
Nové metody výpočtů volných energií pro studium interakcí protein-ligand
Daniela Toulcová