Optimalizace setu mikrosatelitů pro tři kryptické druhy netopýrů rodu Myotis

Mgr. Markéta Jandová

Bakalářská práce

Development of microsatellite sets for three cryptic species of bats of the genus Myotis

Anotace:

Netopýr Alkathoe (Myotis alcathoe) a netopýr Brandtův (Myotis Brandtii) byli až donedávna považováni za poddruh (nebo formu) netopýra vousatého (Myotis mystacinus) a status samostatného druhu získali relativně nedávno. Jedná se o tři kryptické druhy, proto je k jejich spolehlivému odlišení vhodné využít genetické metody. Nedostatek vědomostí o jejich prostorové genetické struktuře, disperzi a dalších populačně-genetických charakteristikách lze pomocí optimálních genetických markerů doplnit. Mikrosatelity jsou vhodnými genetickými znaky pro určování příbuznosti, či pro zmapování populačně-genetické struktury, ale dosud nebyly pro tři výše uvedené druhy popsány. Za použití metody „cross-species“ amplifikace bylo otestováno 34 párů mikrosatelitových lokusů, původně navržených pro 6 druhů netopýrů čeledi Vespertilionidae. Z těch bylo vybráno 12 a byly sestaveny dva multiplexové sety, amplifikující se u všech tří druhů. Kombinovaná analýza mikrosatelitů (buď 6 nebo 12 lokusů) umožňuje 100% odlišení všech tří druhů vícerozměrnými metodami. V práci bylo dále provedeno základní srovnání populačně-genetické variability a struktury těchto druhů, přičemž se zdá, že Myotis alcathoe má nejnižší genetickou variabilitu. Navržené sety mohou být dále využity při dalších populačně-genetických analýzách či při analýzách příbuznosti v rámci jednotlivých populací.

Abstract:

Alcathoe Bat (Myotis alcathoe) and Brand’s Bat (Myotis Brandtii) had been until recently considered a sub-species (or form) of Whiskered Bat (Myotis mystacinus) and were proclaimed a sovereign species relatively recently. They represent three cryptic species that can be reliably distinguished by the means of genetic methods. A lack of knowledge regarding their spatial genetic structure, dispersion and other population-genetic characteristics can be compensated by optimal genetic markers. Microsatellites are genetic markers appropriate for relatedness investigation or population-genetic structure mapping, but have not yet been described for three above mentioned species. A cross-species amplification method had been used for testing 34 pairs of microsatellite loci, originally designed for six species of Vespertilionidae family bats. Twelve out of these loci were selected and combined into two multiplex kits amplifying in all three species. Combined analysis of microsatellites (either six or twelve loci) allows 100% identification of every species by multidimensional methods. The work also describes basic comparison of population-genetic variation and structure of these species. It turns out that Myotis alcathoe has the lowest genetic variation. Suggested kits can be further used for more population-genetic analyses or relatedness analyses in scope of individual populations.

Klíčová slova

mikrosatelity, microsatellites, Myotis alcathoe, Myotis mystacinus, Myotis brandtii, cross-species amplifikace, cross-species amplification, PCR

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 12. 5. 2011

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 17. 6. 2011
• Vedoucí: doc. Mgr. et Mgr. Josef Bryja, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Systematická biologie a ekologie