Determinace patogenní variability v populaci plísně okurkové (Pseudoperonospora cubensis) v České Republice

Nikola VYSLYŠELOVÁ

Bachelor's thesis

Determination of pathogenic variation in populations of Pseudoperonospora cubensis in the Czech Republic

Abstract:

V předložené bakalářské práci jsem se zabývala patogenní variabilitou izolátů P. cubensis, získaných z infikovaných porostů tykvovitých zelenin při sběrových expedicích na území České republiky v roce 2009. U těchto izolátů byly determinovány patotypy, které byly dále zkoumány ve vztahu k jejich geografickému původu. Rovněž byla hodnocena odolnost a náchylnost genotypů diferenciačního souboru Cucurbitaceae pro detekci patotypů P. cubensis (Lebeda a Widrlechner, 2003) vůči studovaném souboru izolátů patogena. V literárním přehledu jsou zpracovány informace o biologii a ekologii P. cubensis, hostitelském okruhu tohoto patogenu, rozšíření P. cubensis a interakcích hostitel-patogen zahrnující patogenismus a zkoumanou patogenní variabilitu a patotypy. Experimentální část této bakalářské práce byla zaměřena na determinaci patogenní variability v populaci P. cubensis v České republice. Pro testování byly použity izoláty P. cubensis pocházející z různých lokalit České republiky získané v roce 2009. K determinaci patogenní variability byla použita metoda listových terčíků (Lebeda, 1990). Celkem bylo získáno 44 izolátů z různých krajů, převážně z Cucumis sativus, pouze dva izoláty byly z druhů Cucumis melo a Cucurbita moschata. V roce 2009 byl vysoký stupeň patogenity zaznamenán u 68% izolátů a střední stupeň patogenity u 32% izolátů P. cubensis. Nízký stupeň patogenity nebyl v roce 2009 u testovaných izolátů P. cubensis determinován. Ve sledovaném roce bylo u 44 testovaných izolátů rozlišeno celkem 14 patotypů, z nichž nejčastěji byl zastoupen patotyp 15.14.10 (45,5 %). Z ostatních 13 determinovaných patotypů se pouze tři z nich (15.2.10, 15.14.11 a 15.10.10) se vyskytly v populaci tohoto patogenu více než jednou.

Abstract:

In this bachelor thesis, I investigated the pathogenic variation of Pseudoperonospora cubensis isolates originated from infected cucurbit plants during the sampling expedicions at the areal of the Czech Republic in the 2009. Pathotypes were determined at these isolates that were also screened in relation to their geographic origin. Resistance and susceptibility of genotypes of differential set of Cucurbitaceae for detection of P. cubensis pathotypes (Lebeda a Widrlechner, 2003) were also assigned against the studied set of pathogen isolates. Information about biology and ecology of P. cubensis, host range, distribution of P. cubensis and host-pathogen interactions including pathogenism and the screened pathogenic variation and pathotypes are described in the theoretical part of this bachelor thesis. Experimental part of this bachelor thesis was focused on the determination of pathogenic variation in P. cubensis population in the Czech Republic. The P. cubensis isolates originated from different locations in the Czech Republic and obtained in the year 2009 were used for screening. A modified-leaf disk method (Lebeda, 1990) was used for determination of pathogenic variation. A total of 44 isolates from different regions, mainly from Cucumis sativus, only two isolates originating from Cucumis melo and Cucurbita moschata was obtained. In the year 2009, the high pathogenicity factor was noted at 68% P. cubensis isolates and medium pathogenicity factor at 32% isolates. No screened P. cubensis isolates belonged to low pathogenicity factor group. 14 pathotypes were detected at 44 screened isolates in the studied year. Pathotype 15.14.10 was the most frequent (45,5%). Other 13 determined pathotypes were less often found, only three of them (15.2.10, 15.14.11 a 15.10.10) occurred more than one in population in this pathogen.

Keywords

tykvovité, interakce hostitel-patogen, náchylnost, odolnost, patogenní variabilita, patotypy, plíseň okurková, plíseň tykvovitých

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 10. 5. 2012

Accessible from:: 10. 5. 2012

Thesis defence

• Supervisor: Prof. Ing. Aleš Lebeda, DrSc.

PALACKÝ UNIVERSITY IN OLOMOUC

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biology / Systematic Biology and Ecology