Algoritmy pro tvorbu seznamu proteinů z hmotnostně spektrometrických dat – protein inference problem – Bc. Daniel Jaroň
Bc. Daniel Jaroň
Bachelor's thesis
Algoritmy pro tvorbu seznamu proteinů z hmotnostně spektrometrických dat – protein inference problem
Algorithms for preparation of the protein list from mass spectrometric data – protein inference problem
Abstract:
Hmotnostní spektrometrie je častá metoda při snaze o charakterizaci proteinového vzorku. Při standartním bottom-up experimentu se vzorky naštěpí enzymem a analyzují hmotnostní spektrometrií ve spojení s kapalinovou chromatografií, čímž vzniká velké množství fragmentačních spekter. Přiřazování spekter k peptidům a peptidů proteinům resp. zpětná rekonstrukce peptidů na proteiny (protein-inference problem …moreAbstract:
Mass spectrometry is frequent method, while trying to characterize protein sample. In standard bottom-up experiment, samples are digested by enzyme and analyzed by mass spectrometry combined with liquid chromatography, which produce great amount of fragmentation spectra. Matching such spectra to peptides, and peptides to proteins, respectively backward reconstruction of peptides to proteins (protein …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 16. 5. 2016
Identifier:
https://is.muni.cz/th/hgu1l/
Thesis defence
- Date of defence: 15. 6. 2016
- Supervisor: Mgr. David Potěšil, Ph.D.
Citation record
ISO 690-compliant citation record:
JAROŇ, Daniel. \textit{Algoritmy pro tvorbu seznamu proteinů z hmotnostně spektrometrických dat – protein inference problem}. Online. Bachelor's thesis. Brno: Masaryk University, Faculty of Science. 2016. Available from: https://theses.cz/id/52yct8/.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceBachelor programme / field:
Biochemistry / Chemoinformatics and Bioinformatics