Studium střevní mikroflory tradičními a molekulárními technikami

Mgr. et Mgr. Tereza Frostová

Bachelor's thesis

Studies of the intestinal microflora by traditional and molecular techniques

Abstract:

Zvyšující se počet vážných onemocnění gastrointestinálního traktu je jedním z důležitých motivů pro podrobnější výzkum střevní mikroflóry u lidí. Cílem je lépe poznat její složení a funkce, ale především důkladněji porozumět složitým vztahům v systému mikrobního společenství. Tyto znalosti jsou také důležité pro objasnění mechanismu pozitivního působení probiotik, které se stále častěji používají k jak preventivním, tak léčebným účelům. Bakalářská práce přináší přehled molekulárně biologických technik vhodných pro studium komplexních mikrobních společenství zažívacího traktu. V práci jsou připomenuty hlavní biochemické a fyziologické procesy, kterých se účastní střevní mikroflóra, a popsány nejvýznamnější v současnosti používané molekulárně biologické metody užívané k jejímu výzkumu; jedná se především o denaturační gradientovou gelovou elektroforézu, teplotní gradientovou gelovou elektroforézu, terminální polymorfismus délky restrikčních fragmentů a metagenomický přístup. U každé metody jsou také stručně zmíněny její hlavní přednosti a nedostatky.

Abstract:

Increasing number of serious gastrointestinal tract diseases has motivated detailed research on human intestinal microbial community. The investigations aim at better understanding of both the relations in the microbial populations and the functions of them. The findings are also important for revealing the mechanism of positive treatment of probiotics, which are used in preventive and treatment medicine more frequently nowadays. The present work deals with research techniques of molecular biology intended for examination of complex intestinal microbial community. Essential biochemical and physiological processes participated by the community are summarised and the most utilized molecular biology techniques are introduced; i.e. denaturing gradient gel electrophoresis, temperature gradient gel electrophoresis separation technique, method of terminal restriction fragment length polymorphism. Also, the main advantages and disadvantages are specified for each method.

Keywords

Mikroflóra, molekulární techniky, mikroflóře přidružená charakteristika, probiotika microflora, molecular techniques, microflora-associated characteristic, probiotics

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 14. 5. 2010

Thesis defence

• Date of defence: 23. 6. 2010
• Supervisor: doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biology / Biology