Úloha dlouhých nekódujích RNA v biologii chronické lymfatické leukémie

Bc. Veronika Krmeská

Master's thesis

The role of long non-coding RNAs in the biology of chronic lymhocytic leukemia

Anotácia:

Pouze 2 % lidského genomu jsou přepisována a přeložena do proteinů. V současnosti je stále více pozornosti věnováno transkribované DNA, která se dále do proteinu nepřekládá. Do této nekódující části patří microRNA (miRNA), které jsou již dobře popsány v souvislosti s mnoha chorobami, ale také dlouhé nekódující RNA (lncRNA). LncRNA jsou definovány jako RNA delší než 200 nukleotidů (nt), které postrádají jakýkoliv otevřený čtecí rámec. V této práci bylo vybráno a zkoumáno několik lncRNA (XIST, H19, GAS5, TUG1, MALAT1, LincRNA-p21, INXS) ve vztahu k nejčastějšímu typu leukémie dospělého věku, chronické lymfocytární leukémii (CLL). Výběr lncRNA byl založen na vztahu mezi lncRNA a signalizačními dráhami, které jsou u CLL deregulované nejčastěji. Exprese lncRNA byla dále porovnána mezi jednotlivými subtypy CLL s cílem odhalit jejich možnou roli ve klinické a biologické variabilitě tohoto onemocnění.

Abstract:

Only 2% of human genome is transcribed and translated into proteins. Nowadays, more and more attention is paid to DNA, which is trascribed but does not encode any protein. This noncoding part contains not just short noncoding RNAs such as microRNAs (miRNAs) which are already well described in relation to many diseases, but also long noncoding RNAs (lncRNAs). LncRNAs are defined as RNAs longer than 200 nucleotides (nt) without any open reading frame. In this thesis, several lncRNAs were selected (XIST, H19, GAS5, TUG1, MALAT1, LincRNA-p21, INXS) and examined in relation to the most common type of adult leukemia, chronic lymphocytic leukemia (CLL). Selection of lncRNAs was based on relationship between these and pathways frequently deregulated in CLL. The expression of lncRNAs was measured and compared between the CLL subtypes to reveal their hypothetical roles in the clinical and biological heterogeneity of CLL.

Keywords

CLL, lncRNA, XIST, H19, GAS5, TUG1, MALAT1, LincRNA-p21, INXS

Jazyk práce: English

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 5. 1. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 8. 2. 2017
• Vedúci: doc. MUDr. Mgr. Marek Mráz, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Experimental Biology / Molecular Biology and Genetics