Variabilita genu pro OspC u izolovanych kmenů Borrelia burgdorferi sensu lato

Bc. Adam Norek, DiS.

Master's thesis

OspC gene variability of Borrelia burgdorferi sensu lato isolated strains

Anotácia:

Lymeská borelióza je vektorem přenášené onemocnění, vyvolávané spirochetami Borrelia burgdorferi sensu lato. Za hlavního přenášenče je považováno klíště z čeledi Ixodidae. Bbsl je charakteristická širokou variabilitou antigenních struktur, což komplikuje diagnostiku a léčbu tohoto onemocnění a také konstrukci účinné vakcíny. Jedním z hlavních povrchových antigenů je protein OspC, kterým se zabývá i tato DP. K tomuto účelu používá metody molekulární analýzy DNA, polymerázová řetězová reakce, mapování polymorfismu restrikčních fragmentů, technika klonování produktu PCR do plasmidového vektoru a sekvencování. Mezi jmenované metody lze zařadit nově zkonstruovanou polymerázovou řetězovou reakci určenou k syntéze otevřeného čtecího rámce genu ospC. K porovnání vzájemné variability OspC u studovaných kmenů bylo využito srovnání s fylogeneticky stálým proteinem FlaA. FlaA byl použit i při identifikaci a kvantifikaci zkoumaných izolátů.

Abstract:

Lyme disease is vector borne disease caused by vector borne spirochetes Borrelia burgdorferi sensu lato. The principal vector is hard tick (Ixodidae). Bbsl is characteristic by highly polymorfic antigenic determinants. OspC represent one of the major antigen which is utilized during the early stages of infection. The aim of this study was evaluation of ospC gene variability among the strains isolated from South Moravia area. Methods of molecular biology polymerase chain reaction, restriction fragment length polymorphism analysis, DNA cloning and DNA sequencing was utilized for this purpouse. New PCR technique targeting ospC open reading frame was introduced. FlaA gene was used as criterion for evaluation of ospC variability as well as for species identification.

Kľúčové slová

Outer membrane protein, flagellin, OspC, PCR, RFLP, sekvencování, klonování

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 18. 5. 2009

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 11. 6. 2009
• Vedúci: doc. RNDr. Alena Žákovská, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biology / General Biology