Cross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu trubkonosí u pelikána skvrnozobého (Pelecanus philippensis)

Barbora MACKOVÁ

Bakalářská práce

Cross-species amplification of microsatellites from Procellariiformes in Spot-billed Pelican (Pelecanus philippensis).

Anotace:

Náplní této bakalářské práce bylo nalezení polymorfních mikrosatelitních lokusů u pelikána skvrnozobého pomocí cross-species PCR amplifikace. V teoretické části jsem se věnovala zařazení pelikána skvrnozobého do systému, popisu řádu pelikáni, rodu pelikán a pelikána skvrnozobého. Dále je zde uvedena obecná charakteristika mikrosatelitů a jejich dělení. V praktické části jsem používala metodu cross-species PCR amplifikace pro testování polymorfismu mikrosatelitních lokusů u 6 nepříbuzných jedinců pelikána skvrnozobého s využitím 213 párů primerů. 207 párů primerů bylo navrženo pro zástupce z řádu trubkonosí. 5 párů primerů od zástupců řádu dlouhokřídlí a 1 od zástupce řádu pěvci poskytly u zástupců z řádu trubkonosí polymorfní produkt, proto byly také využity pro testování. Z těchto mikrosatelitů jich 22 poskytlo polymorfní produkt, 189 monomorfní produkt a dva páry primerů produkt neposkytly.

Abstract:

The aim of this bachelor's thesis was to find polymorphic microsatellite loci of the spot-billed pelican by employing the cross-species PCR amplification. The theoretical part of my thesis was focused on scientific classification of the spot-billed pelican, the description of the family Pelecanidae, the genus Pelecanus and the species P. phillipensis. It also included a general characteristic and typecasting of microsatellites. In the practical part, I have applied the cross-species PCR amplification method to test the polymorphism of microsatellite loci of six unrelated individuals of the spot-billed pelican, using 213 primer pairs. 207 primer pairs were designed from members of Procellariiformes. 5 primer pairs from members of Charadriiformes and 1 primer pair from a member of Passeriformes have provided the polymorphic product for Procellariiformes species, hence the utilisation of these for testing. Of these microsatellites, 22 have provided the polymorphic product, 189 provided the monomorphic product, ant two primer pairs have provided none

Klíčová slova

pelikán skvrnozobý, Pelecanus philippensis, trubkonosí, Procellariiformes, mikrosatelit, PCR amplifikace

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 30. 7. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: RNDr. Petr Nádvorník, Ph.D.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární a buněčná biologie