Effects of hyperparameters in multiple sequence alignment for Align-RUDDER using Clustal – Christian SAMWALD
Christian SAMWALD
Bachelor's thesis
Effects of hyperparameters in multiple sequence alignment for Align-RUDDER using Clustal
Sequence Alignment, Clustal Omega, Reinforcement learning
Abstract:
Delayed rewards are detrimental to the learning of reinforcement learning agents.One approach to this problem is the usage of return decomposition and rewardredistribution. It was realised in the Align-RUDDER algorithm of Patilet al.[14].Their solution employed the multiple sequence alignment algorithm Clustal W. Iintegrated the sequence alignment Tool Clustal, Clustal W's successor, intoAlign RUDDER …viacAbstract:
Delayed rewards are detrimental to the learning of reinforcement learning agents.One approach to this problem is the usage of return decomposition and rewardredistribution. It was realised in the Align-RUDDER algorithm of Patilet al.[14].Their solution employed the multiple sequence alignment algorithm Clustal W. Iintegrated the sequence alignment Tool Clustal, Clustal W's successor, intoAlign RUDDER …viac
Jazyk práce: English
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 22. 3. 2021
Obhajoba závěrečné práce
- Vedúci: prof. Dr. Sepp Hochreiter
Citační záznam
Citace dle ISO 690:
SAMWALD, Christian. \textit{Effects of hyperparameters in multiple sequence alignment for Align-RUDDER using Clustal}. Online. Bakalárska práca. České Budějovice: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Faculty of Science. 2021. Dostupné z: https://theses.cz/id/5jsqun/.
Jak správně citovat práci
SAMWALD, Christian. Effects of hyperparameters in multiple sequence alignment for Align-RUDDER using Clustal. Č. Budějovice, 2021. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- Soubory jsou od 22. 3. 2024 dostupné: světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH, Přírodovědecká fakultaUNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE
Faculty of ScienceBachelor programme / odbor:
Applied Informatics / Bioinformatics
Práce na příbuzné téma
-
Multiple sequence alignment pomocí dynamického programování
Martin Rusek -
Influence of Clustal W hyperparameters in multiple sequences alignment for AlignRUDDER
Marlene GANZ -
Grammatikfehlerkorrektur mit Deep Reinforcement Learning
Raj Kumar RANA -
Influence of Clustal W hyperparameters in multiple sequences alignment for AlignRUDDER
Marlene GANZ -
Influence of Clustal W hyperparameters in multiple sequences alignment for AlignRUDDER
Marlene GANZ