Validácia genotypizácie HPV33 a HPV51 v cervikálnych steroch.

Júlia MARTINKOVÁ

Diplomová práce

Validation of HPV33 and HPV51 genotypization in cervical smears.

Anotace:

Cervikálny karcinóm (CCa) je spôsobený perzistentnou infekciou vysokorizikových ľudských papilomavírusov (hrHPV). Novo navrhnuté detekčné systémy boli testované na 40 vzorkách, u ktorých bola opakovanou analýzou potvrdená prítomnosť HPV33 v 95 %. U 57 vzorkách bola opakovanou detekciou potvrdená prítomnosť HPV51 v 98,3 % prostredníctvom multiplex real-time PCR. Genotypizácia všetkých cervikálnych a cerviko-vaginálnych sterov bola prevedená prostredníctvom PapilloCheck? HPV-Screening (Greiner Bio-One). Analytické parametre získané z dát vyhodnotili 95% senzitivitu pre HPV33 a 98,2% pre HPV51. Špecificita pre obidva genotypy bola 100 %. Detekčné systémy umožnili analyzovať v multiplexu až 4 kópie/reakciu u HPV33. Boli schopné detekovať integrovanú (I) a zmiešanú (Z) formu HPV, ktoré predstavujú zvýšené riziko vzniku cervikálnych intraepiteliárnych lézií s následnou progresiou do CCa. I forma bola zistená v 67,5 % a Z v 20 % vzoriek u HPV33. V prípade HPV51 nebola detekovaná ani jedna z nich. Detekčné systémy boli aplikované len na hrHPV HPV33 a HPV51, ktoré sú v českej populácií zastúpené v minimálnom množstve. Tieto testy by boli vhodné pre ďalší výskum iných hrHPV. Zároveň by bolo potrebné vyšetriť omnoho väčšie množstvo vzoriek u žien nad 30 rokov, aby boli navrhnuté detekčné systémy zvažované na screening HPV.

Abstract:

Cervical carcinoma (CCa) is caused by a persistent infection of high-risk human papillomaviruses (hrHPV). Recently designed detection systems have been tested on 40 samples, which were repeatedly confirmed by the presence of HPV33 in 95 %. In 57 samples, repeated detection confirmed the presence of HPV51 in 98.3 % via multiplex real-time PCR. Genotyping of all cervical and cervico-vaginal smears has been performed by PapilloCheck? HPV-Screening (Greiner Bio-One). Review from analytical data we have got in 95% sensitivity for HPV33 and 98.2% for HPV51. The specificity for both genotypes was 100 %. Detection systems have been able to analyze up to 4 copies/response in HPV33 in the multiplex. They have been able to detect integrated (I) and mixed (Z) forms of HPV, which present an increased risk of cervical intraepithelial lesions followed by progression to CCa. I form was found in 67.5 % and Z in 20 % of samples in HPV33. For HPV51 haven't been detected any samples. Detection systems have been applied only to hrHPV HPV33 and HPV51, which are minimally represented in the Czech population. These tests would be right for further investigation of other hrHPV. At the same time, much large number of samples should be examined in women over 30 years old in order to design the detection systems considered for HPV screening.

Klíčová slova

cervikálny karcinóm, HPV test, real-time PCR

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 11. 5. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Hana Jaworek

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie