Afrotropické bělozubky rodu Crocidura v kontextu rejskovitých hmyzožravců Konga

Bc. Michal Bureš

Bachelor's thesis

Afrotropical white-toothed shrews of the genus Crocidura in context of Congolese shrew fauna

Abstract:

Oblast jihozápadního Konga je stále málo probádanou oblastí a dosud zde neproběhl výzkum týkající se čeledi Soricidae. Jedná se o jednu z nejméně prozkoumaných čeledí savců a jejich fylogenetické vztahy nejsou dosud zcela uspokojivě popsány. Cílem této práce bylo zjistit druhové složení čeledi Soricidae v jihozápadním Kongu na základě markeru cytochromu b, který je vhodný pro určování savců do jednotlivých druhů. Dalším cílem byla fylogenetická analýza afrických zástupců čeledi Soricidae a popsat jednotlivé linie a zjistit vztahy vzorků z jihozápadního Konga ve vztahu k africkým zástupcům této čeledi. Dalším cílem byla fylogenetická analýza rodu Crocidura, který je nejvíce diverzifikovaný v aftrotropické oblasti. Z 64 vzorků jsem získal spolehlivá data z 62 vzorků, které jsem následně určil do 10 druhů ¬- Crocidura attila, Crocidura batesi, Crocidura crenata, Crocidura dolichura, Crocidura goliath, Crocidura grassei, Paracrocidura schoutedeni, Suncus remyi, Sylvisorex johnstoni, Sylvisorex ollula. Z fylogenetické analýzy mi vyplynulo, že podčeleď Crocidurinae je dobře oddělená od ostatních zástupců čeledi Soricidae. Mezirodové vztahy nebyly dobře prokázány a to z důvodu charakteru vybraného genetického markeru cytochromu b. Nebyla potvrzena teorie o monofylii rodu Crocidura, ani jeho rozdělení na 3 klady. Potvrdil jsem, že rod Scutisorex v sobě zahrnuje druhy Sylvisorex konganensis a Sylvisorex ollula. Tyto dva druhy se v mé studii nachází na bazální pozici rodu Scutisorex, což dosud nebylo publikováno v žádné předcházející studii. V rámci mé studie se tedy ukázal rod Sylvisorex jako parafyletický, stejně jako rod Suncus, u kterého sice byly odděleny dvě větve (africká a eurasijská), nicméně toto rozdělení nemělo v mé fylogenetické analýze potřebnou podporu. Rod Paracrocidura se ukázal jako monofyletický, ale s nejistým zařazením v rámci rodu Crocidura. Na základě mé fylogenetické analýzy zástupci druhů Crocidura maxi a Crocidura monticola z ostrovů Jáva a Borneo vytvořily dvě větve. Jedna větev zahrnovala zástupce obou druhů z ostrova Jáva a druhá větev také zahrnovala zástupce obou druhů, ale z ostrova Borneo. Bylo by vhodné srovnat populace těchto dvou druhů na ostrovech Jáva a Borneo. Má fylogenetická analýza obsáhla největší počet vzorků a druhů rejskovitých než jakákoliv jiná dosud publikovaná studie a poskytla náhled na samostatné linie druhů čeledi Soricidae a v dalších studiích by bylo potřebné tyto údaje doplnit o jaderné markery, aby se určily vztahy na vyšších fylogenetických pozicích.

Abstract:

The area of southwestern Congo is still deficiently explored region, and yet in this area had not exist research specialized on family Soricidae. It is one of the least explored families of the mammals and their phylogenetic relationships are not yet fully satisfactory described. The aim of this study was to determine the species composition of the family Soricidae in southwestern Congo based on marker cytochrome b, which is suitable for determining the mammals of different species. Another aim was the phylogenetic analysis of African representatives of the family Soricidae and describe individual lines and determine relationships of the samples from the southwestern Congo in relation to African representatives of this family. My next aim was phylogenetic analysis of the genus Crocidura, which is the most diversified in aftrotropical area. The 62 samples from 64 samples were applicable, I determined 10 species - Crocidura attila, Crocidura bates, Crocidura crenata, Crocidura dolichura, Crocidura goliath, Crocidura grassei, Paracrocidura schoutedeni, Suncus remyi, Sylvisorex johnstoni, Sylvisorex ollula. My phylogenetic analysis showed that subfamily Crocidurinae is well separated and well suported from the other members of the family Soricidae. The relations between genus have not been established and because of the character of my genetic marker cytochrome b. It was not confirmed the theory of the monophyly of the genus Crocidura. It was not confirmed the theory about three clades of the gengus Crocidura. I confirmed that genus Scutisorex includes two species - Sylvisorex konganensis and Sylvisorex ollula. In my study these two species are in the basal position of family Scutisorex, which has not been published in any study. In my study, genus Sylvisorex is paraphyletic as well as genus Suncus In the genus Suncus have been separated two branches (African and Eurasian) however this branches was low supported in my phylogenetic analysis. The genus Paracrocidura is monophyletic in my study but uncertain classification within the genus Crocidura. Based on my phylogenetic analysis, it seems that the representatives of the species Crocidura maxi and Crocidura monticola from the islands of Java and Borneo are distinct species, because the samples of these two species clustered to each other but created two branches - one from Java and one from Borneo. My phylogenetic analysis has encompassed the largest number of samples and species of the family Soricidae than any other previously published study and provided insight into separate branches of the species of family Soricidae. In the future studies would be necessary to supplement these data on nuclear markers to determine the phylogenetic relationships in the higher positions of the family Soricidae.

Keywords

Rejskovití, Soricidae, bělozubky, Crocidura, Konžská pánev, Kongo, hmyzožravci, Eulipotyphla, Suncus, Congosorex, Sylvisorex, Scutisorex.

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 2. 5. 2016

Thesis defence

• Date of defence: 10. 6. 2016
• Supervisor: Mgr. Adam Konečný, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Ecological and Evolutionary Biology / Ecological and Evolutionary Biology