Analýza a charakteristika vybraných polymorfních cross-species mikrosatelitů z řádu tučňáci a konzervovaných ptačích mikrosatelitů u plameňáka karibského (Phoenicopterus ruber)

Bc. Monika ŠULÁKOVÁ

Master's thesis

The analysis and characterization of selected polymorphic cross-species microsatellites from Sphenisciformes and conserved avian microsatellites in Caribbean Flamingo (Phoenicopterus ruber)

Anotácia:

V této diplomové práci jsem analyzovala a charakterizovala vybrané mikrosatelity u plameňáka karibského (Phoenicopterus ruber). V teoretické části jsem se zabývala systémem ptáků především na základě molekulárních metod s důrazem na řád plameňáci (Phoenicopteriformes) a taxonomii plameňáka karibského, jeho biologii a ekologii. Následně jsem se věnovala molekulárně genetickým charakteristikám populací s důrazem na mikrosatelity. Také jsem popsala veškeré dosud charakterizované polymorfní mikrosatelity pro plameňáka karibského. V praktické části jsem pomocí cross-species PCR amplifikace analyzova 22 polymorfních mikrosatelitů na DNA 30 nepříbuzných jedinců plameňáka karibského, které jsem následně charakterizovala v programu Cervus 3.0.6 a testovala pomocí programu Genepop 4.2.

Abstract:

In this master's thesis I analyzed and characterized selected microsatellites in American flamingo (Phoenicopterus ruber). In the theoretical part I dealt with the system of birds mainly on the basis of molecular methods with emphasis on the Phoenicopteriformes and taxonomy of the American flamingo, its biology and ecology. Subsequently I focused on molecular genetic characteristics of populations with emphasis on microsatellites. I have also described all the previously characterized polymorphic microsatellites for the American flamingo. In the practical part I analyzed 22 polymorphic microsatellites by cross-species PCR amplification of DNA of 30 unrelated individuals of the American flamingo, which I subsequently described in Cervus 3.0.6 and tested using Genepop 4.2.

Kľúčové slová

plameňák karibský, Phoenicopterus ruber, mikrosatelit, cross-species PCR amplifikace, tučňák

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 10. 5. 2019

Obhajoba závěrečné práce

• Vedúci: RNDr. Petr Nádvorník, Ph.D.

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Ecology and Environmental Protection / Ecology and Environmental Protection