Afinitní purifikace proteinů interagujících s deriváty roscovitinu

Eva SZCZYRBOVÁ

Bakalářská práce

Affinity chromatography purification of proteins interacting with roscovitine derivates.

Anotace:

Afinitní chromatografie je separační technika, která k izolaci složky z komplexního vzorku využívá její speciální interakci s vazebným partnerem ligandem. V této práci byla užitím proteomických technik řešena problematika interakcí proteinů s potenciálními léčivy. Práce se tedy zabývá afinitními purifikacemi proteinů lyzovaných nádorových buněk linie HCT 116. Jako ligandy sloužily tři deriváty roscovitinu, selektivního inhibitoru CDK. Na základě analýzy dat byly určeny proteiny specificky interagující s ligandy. Výsledkem byla identifikace potenciálních terapeutických cílů roscovitinových derivátů.

Abstract:

Affinity chromatography is a separation technique which can be used for the isolation of the analyzed compounds from the complex samples by utilizing their specific interaction with the ligand binding partner. In this work we focuse on the topic of protein interactions with potential drugs. Thus, we engaged the affinity purification of proteins from the colorectal carcinoma cells HCT 116 with subsequent mass spectrometry analysis. As ligands served three structural analogs of roscovitin, a selective CDK inhibitor. Following statistical data analysis, proteins specifically interacting with particular roscovitine ligands were identified.

Klíčová slova

Afinitní chromatografie, roscovitine, nádorová onemocnění, buněčný cyklus, cyklin-dependentní kinázy.

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 17. 5. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Radim Simerský, Ph.D.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie