Bc. Markéta Opichalová

Bachelor's thesis

Input Manipulation Module for Biochemical Space Language

Input Manipulation Module for Biochemical Space Language
Abstract:
Modelování biochemických systémů se v oblasti výpočetní biologie se používá k porozumění složitým interakcím a predikci chování. Biochemical Space Language (BCSL) poskytuje stručný a intuitivní přístup založený na tzv. pravidlech pro modelování. Nástroj eBCSgen, který slouží k vývoji a analýze BCSL, čelí nedostatkům ve svém modulu manipulace s vstupy, zejména při parsování a transformaci vstupních …more
Abstract:
In computational biology, modeling biochemical systems is used to understand complex interactions and predict behaviors. The Biochemical Space Language (BCSL) provides a concise and intuitive rule-based approach to modeling. eBCSgen, a tool for developing and analyzing BCSL, faces challenges in its input manipulation module, particularly in parsing and accurately transforming input data. This thesis …more
 
 
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 23. 5. 2024

Thesis defence

  • Date of defence: 26. 6. 2024
  • Supervisor: doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D.
  • Reader: RNDr. Samuel Pastva, Ph.D.

Citation record

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatiky

Masaryk University

Faculty of Informatics

Bachelor programme / field:
Programming and development / Programming and development