Identifikace a modulace přechodové charakteristiky feromonové signální dráhy

Anna SOSNOVÁ

Bachelor's thesis

Identification and modulation of the pheromone response pathway step response

Abstract:

Ste12 protein serves as the key transcription factor that regulates the expression of yeast mating genes after pheromone induction. It is a crucial component of several feedback loops within the yeast pheromone response pathway. This work studies, in silico and in vivo, the replacement of the wild type transcription factor with a synthetic transcription factor within the pathway. Both synthetic and wild type transcription factors were characterized and compared. Pheromone dose response was measured and its vertical shift caused by different transcription factor concentrations was described.

Abstract:

Ste12 protein slouží jako klíčový transkripční faktor, který reguluje expresi kvasinkových párovacích genů po přídání feromonu. Je důležitou součástí několika zpětnovazebných smyček feromonové signální dráhy. Tato práce se zabývá, in silico a in vivo, náhradou přirozeného transkripčního faktoru syntetickým. Oba transkripční faktory byly popsány a vzájemně porovnány. Statická charakteristika feromonové aktivace byla naměřena a změnou koncentrace transkripčního faktoru byl docílen její vertikální posun.

Keywords

statická charakteristika, network-free modelování, kvasinky, párování, feromonová signální dráha, transkripční faktor, feromon

Language used: English

Date on which the thesis was submitted / produced: 13. 5. 2016

Accessible from:: 31. 12. 2999

Thesis defence

• Supervisor: Daniel Georgiev, PhD.

University of West Bohemia

Faculty of Applied Sciences

Bachelor programme / field:
Applied Sciences and Computer Engineering / Cybernetics and Control Engineering