Výpočetní studie reakčních mechanismů enzymatických reakcí – Bc. Daniel Uherek
Bc. Daniel Uherek
Diplomová práce
Výpočetní studie reakčních mechanismů enzymatických reakcí
Computational Study of Enzymatic Reaction Mechanisms
Anotace:
Glykosyltransferázy jsou důležitou třídou enzymů, z nichž mnohé jsou zapojeny do závažných onemocnění. Katalyzují tvorbu nové glykosidické vazby mezi cukernou složkou a akceptorem, typicky dalším cukrem. Obvykle jsou glykosyltransferázy specifické pro substrát, což z nich činí vhodný cíl pro návrh nových léků. Nicméně přesné struktury mnoha glykosyltransferáz nejsou známy, což brzdí pokrok v navrhování …víceAbstract:
Glycosyltransferases are an important class of enzymes, many of which are involved in serious diseases. They catalyse the formation of a new glycosidic linkage between a sugar moiety and an acceptor, typically another sugar. Usually, glycosyltransferases are substrate-specific, which makes them suitable targets for the design of new drugs. However, exact structures are unknown for many glycosyltransferases …víceKeywords
glykosyltransferázy galaktofuranosyltransferáza 1 Mycobacterium tuberculosis reakční mechanismus QM/MM molekulové modelování molekulové simulace tranzitní stav simulované žíhání výpočty volných energií glycosyltransferases galactofuranosyltransferase GlfT1 reaction mechanism molecular modelling molecular simulations transition state simulated annealing free energy calculations
Jazyk práce: angličtina
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 5. 2024
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/jyakq/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 27. 6. 2024
- Vedoucí: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
- Oponent: Mgr. Stanislav Kozmon, Ph.D.
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasarykova univerzita
Přírodovědecká fakultaMagisterský studijní program / obor:
Chemie / Organická chemie
Práce na příbuzné téma
-
Měření aktivity zinkové proteasy Zmp1 z Mycobacterium tuberculosis pomocí MALDI-TOF MS
Tereza SEVERINOVÁ -
Bioinformatické vyhledávání GT-C glykosyltransferas v genomu bakterie <I>Mycobacterium tuberculosis</I>
Jana Márová -
Bioinformatická analýza potenciálních glykosyltransferas z Mycobacterium tuberculosis
Zuzana Žufanová -
Free Energy Calculations as a Tool of Supramolecular and Biomolecular Chemistry
Zora Střelcová -
Molekulová dynamika a výpočty volných energii mono a di-nukleotidových analogů s potenciálním antibiotickým účinkem
Hana Zigová -
Výpočty volných energií konformačních změn vybraných fragmentů nukleových kyselin
Barbora Benešová -
Použití metod pro výpočet volných energií k studiu biomolekulárních procesů
Ivo Kabelka -
Nové metody výpočtů volných energií pro studium interakcí protein-ligand
Daniela Toulcová