Potvrzení výskytu \kur{Beauveria caledonica} v NP Šumava pomocí metod molekulárních markerů

Bc. Richard BINDER

Master's thesis

Confirmation of \kur{Beauveria caledonica} occurence in Šumava National park by molecular markers

Abstract:

Biologická ochrana rostlin proti hmyzím škůdcům představuje významnou alternativu vůči ochraně chemické. Jedna z velmi významných skupin, použitelných v biologické ochraně rostlin proti hmyzím škůdcům jsou entomopatogenní houby. Entomopatogenní houby jsou mikroskopické houby, které jsou schopny vyvolávat primární onemocnění hmyzích škůdců. Je to druhově velmi heterogenní skupina a celosvětově bylo izolováno a popsáno více než 750 druhů entomopatogenních hub. Mezi nejvýznamnější rody entomopatogenních hub patří rod Beauveria. V České republice byl zaznamenán výskyt rodů B. bassiana, B. brongniartii a nově, na základě této práce, B. caledonica. Tato studie je zaměřena na potvrzení výskytu B. caledonica v NP Šumava. K potvrzení výskytu byly využity analýzy založené na metodách molekulárních markerů. Molekulární markery jsou nepostradatelnou součástí vědy v oblasti mykologie zahrnující například popis kmenů, populační genetiku, detekci a identifikaci hub, fylogenetické studie a evoluční biologii. Pro tuto studii byly použity sekvenační analýzy regionů ITS, EF1- a LSU. Výstupní data těchto analýz byla použita na vytvoření fylogenetických stromů. Výsledkem je druhové zařazení zkoumaných izolátů.

Abstract:

Biological plant protection against insect pests is an important alternative to chemical protection. One of the most important group used in the biological plant protection against insect pests are the entomopathogenic fungi. Entomopathogenic fungi are microscopic fungi that are able to induce a primary disease to insect pests. It is a very heterogeneous group of species. Worldwide there were isolated and described more than 750 species of entomopathogenic fungi. Genus Beauveria is considered one of the most important genera of entomopathogenic fungi. In the Czech Republic there has been confirmed species B. bassiana, B. brongniartii and now, on the basis of this work, B. caledonica. This study is aimed to confirm the occurrence of B. caledonica in National Park Šumava. To confirm this occurrence, I used analyzes based on the methods of molecular markers. Molecular markers are an indispensable part of science in the field of mycology, for example the strain characterization, population genetics, detection and identification of fungi, phylogenetic studies and evolutionary biology. For this study there were used sequence analysis of ITS, EF1- and LSU regions. The output data of these analyzes were used to create phylogenetic trees. The result of my thesis is taxonomical classification of studied isolates on species level.

Keywords

Ascomycota, Beauveria, B. caledonica, entomopatogenní houby, biologická kontrola, molekulární markery

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 24. 4. 2015

Accessible from:: 24. 4. 2015

Thesis defence

• Supervisor: Ing. Kateřina ŠIMÁČKOVÁ, XXX

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Agriculture

Master programme / field:
Agriculture Engineering / Agricultural Biotechnology