Filip ZIMANDL

Bachelor's thesis

Conformational Study of a Flexibility of the Fluorescence Dye QSY21

Conformational Study of a Flexibility of the Fluorescence Dye QSY21
Abstract:
Tato bakalářská práce se týká teoretické studie flexibility fluorescenčního barviva QSY 21. Hlavním úkolem práce bylo najít energeticky nejstabilnější konformery ve vodném prostředí a poskytnout tak vhodnou startovní strukturu pro MD simulaci barviva navázaného na DNA. Dále byla spočtena bariéra rotace mezi centrálním xanthenovým kruhem a postranním aromatickým řetězcem. Výpočty prokázaly ve shodě …more
Abstract:
This bachelor thesis is focused on a theoretical study of the flexibility of the QSY 21 fluorescence dye. The main aim of this work was to find the most stable conformers of the isolated dye and thus provide the suitable starting structure of the dye for the MD simulation of the QSY 21 bound to the DNA. The torsion barrier between the central xanthene ring and the side ring was evaluated, showing the …more
 

Keywords

Výpočetní chemie kvantová mechanika flourescenční barvivo QSY 21 DNA konformace struktura fluorescence FRET simulace
 
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 24. 5. 2010
Accessible from:: 24. 5. 2010
Identifier: 20453

Thesis defence

  • Date of defence: 21. 6. 2010

Citation record

Cite this text
The right form of listing the thesis as a source quoted

ZIMANDL, Filip. Conformational Study of a Flexibility of the Fluorescence Dye QSY21. Č. Bud., 2010. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Full text of thesis

Accessibility: Autor si přeje zpřístupnit práci veřejnosti až od 24. 05. 2010

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • Soubory jsou od 24. 5. 2010 dostupné: světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH, Přírodovědecká fakulta

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biochemistry / Biological Chemistry

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.
 
Name
Posted by
Uploaded/Created
Rights
Theses 6abycv 6abycv/2
20/8/2010
Folders
Files
thesis bakalarkaFINAL.pdf
Bulánová, L.
21/8/2010

  • Co je jinak přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Co je jinak další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Co je jinak pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Co je nové vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Co je nové rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.

  • Co se chystá

    Připravujeme další vylepšení pro mobilní zařízení.