Expresní profil transkripčního faktoru NFkappaB v průběhu makrofágové diferenciace

Bc. Markéta Kaucká, Ph.D.

Master's thesis

Expression profile of the NFkB transciption factor during macrophage

Anotácia:

Exprese onkogenu v-myb zabraňuje buňkám linie BM2 dokončit monocytickou/ makrofágovou dráhu. Tento blok lze překonat působením forbolesteru TPA a nebo inhibitorem histonových deacetyláz trichostatinem A. Působením TPA buňky BM2 diferencují do stádia jednojaderných makrofágů. Naproti tomu po aplikaci TSA buňky diferencují do stádia mnohojaderných makrofágů. Je známo, že důležitý vliv na diferenciační dráhu má transkripční faktor NFkB, který je přítomen ve všech typech živočišných buněk, ale ve větší míře je produkován v hematopoetické linii. Cílem této diplomové práce je stanovit rozdíly v kinetice exprese genů pro jednotlivé podjednotky transkripčního faktoru NFkB v buňkách leukemické linie BM2 v průběhu diferenciace vyvolané TPA a TSA a porovnat expresní profily podjednotek NFkB u terminálně diferencovaných buněk vzniklých působením dvou zmíněných induktorů. Dalším cílem je připravit expresní vektor kódující inhibiční protein IkB, který bude vhodný k testu významnosti transkripčního faktoru NFkB v makrofágové difereciaci leukemických buněk BM2.

Abstract:

BM2 cells constitutively express the v-myb oncogene of AMV and can not undergo terminal differentiation of the monocyte/macrophage pathway. These non-adherent cells can be induced to follow differentiation either into adherent mononuclear macrophages upon treatment with TPA (250 ng/ml, 24 hours) or into multinuclear adherent macrophages upon treatment with TSA (12 ng/ml, 4 days). Using qRT-PCR we analyzed the expression kinetics of the NFkB transcription factor subunits in both these pathways.Our results suggest that there are specific gene expression profiles typical for these two macrophage cell types allowing participation of distinct NFkB subunits on these pahways and constitutive pools of proteins needed for specific macrophage functions.

Kľúčové slová

NF-kappaB, makrofág, diferenciace, expresní profil, RT-PCR NF-kappaB, macrophage, differentiation, expression profile, RT-PCR

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 5. 2008

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 17. 6. 2008
• Vedúci: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biology / Molecular Biology and Genetics