Enzymatická studie oxidace anorganických sirných látek

Bc. Juraj Turis

Diplomová práce

Enzymatic study of the oxidation of inorganic sulfur compounds

Abstract:

The diploma thesis deals with the sulfur metabolism in extremely acidophilic Acidithiobacillus ferrooxidans, focusing on the enzyme sulfurdioxygenase. Within it was described and compared the proposed mechanisms of sulfur metabolism in the individual species of the genus Acidithiobacillus. The method of determining the enzymatic sulfurdioxygenase activity was optimized. Protein with sulfurdioxygenase activity was partially purified by ion exchange and gel chromatography and identified as sulfurtransferase TusA using liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry. Pulldown analysis in combination with affinity chromatography and liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry revealed proteins interacting with glutathione, which is an essential co-factor for bacterial sulfur oxidation.

Abstract:

Diplomová práce se zabývá metabolismem síry a redukovaných sirných látek u extrémně acidofilní bakterie Acidithiobacillus ferrooxidans se zaměřením na enzym síradioxygenázu. V rámci této práce byly popsány a porovnány předpokládané mechanismy metabolismu síry a redukovaných sirných látek u jednotlivých druhů rodu Acidithiobacillus. Byla optimalizována metoda stanovení enzymatické síradioxygenázové aktivity. Protein se síradioxygenázovou aktivitou byl částečně přečištěn kombinací iontoměničové a gelové chromatografie a identifikován jako síratransferáza TusA pomocí kapalinové chromatografie spojené s tandemovou hmotnostní spektrometrií. Pull-down analýza v kombinaci s afinitní chromatografií a kapalinovou chromatografií spojenou s tandemovou hmotnostní spektrometrií odhalila proteiny, které interagují s glutathionem, což je nezbytný kofaktor pro bakteriální oxidaci síry.

Klíčová slova

Acidithiobacillus ferrooxidans, sulfurdioxygenase, sulfurtransferase TusA, sulfur metabolism, sulfurdioxygenasa, síratransferasa TusA, sirný metabolismus

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 8. 1. 2019

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 6. 2. 2019
• Vedoucí: Mgr. Jiří Kučera, Ph.D., doc. Ing. Martin Mandl, CSc.
• Oponent: Mgr. Vojtěch Sedláček, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie