Řešení 3D struktury proteinů na atomární rovni se zaměřením na lektiny a glykosyltransferasy

Bc. Jan Alán

Master's thesis

3D protein structure determination focused on lectins and glycosyltransferases

Abstract:

Tato práce se zabývá strukturními studiemi lektinu (protein specificky vázající sacharidy) CV-IIL z bakterie Chromobacterium violaceum a glykosyltransferasy rv3782 z bakterie Mycobacterium tuberculosis. Práce je rozdělena na dvě části. První část se věnuje produkci, purifikaci a krystalizaci glykosyltransferasy Rv3782 a druhá část je zaměřena na počítačové zpracování dat, získaných difrakcí rtg záření na krystalu lektinu CV-IIL v komplexu s L-fukosyl-laktosou.

Abstract:

Thesis is focused on structure studies of lectin (carbohydrate binding protein) CV-IIL from bacteria Chromobacterium violaceum and glycosyltransferase rv3782 from bacteria Mycobacterium tuberculosis. It is divided into two parts. The first part attends to production, purification and crystallization of glycosyltransferase Rv3782 and second part targets the computational analysis of data, mined by X-ray diffraction on crystal of lectin CV-IIL in complex with L-fucosyl-lactose.

Keywords

lektin, glykosyltransferasa, glykobiochemie, Chromobacterium violaceum, Mycobacterium tuberculosis, krystalografie, refinement

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 23. 5. 2007

Thesis defence

• Date of defence: 22. 6. 2007
• Supervisor: prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
• Reader: doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Biochemistry / Biomolecular Chemistry