Řešení 3D struktury proteinů na atomární rovni se zaměřením na lektiny a glykosyltransferasy

Bc. Jan Alán

Diplomová práce

3D protein structure determination focused on lectins and glycosyltransferases

Anotace:

Tato práce se zabývá strukturními studiemi lektinu (protein specificky vázající sacharidy) CV-IIL z bakterie Chromobacterium violaceum a glykosyltransferasy rv3782 z bakterie Mycobacterium tuberculosis. Práce je rozdělena na dvě části. První část se věnuje produkci, purifikaci a krystalizaci glykosyltransferasy Rv3782 a druhá část je zaměřena na počítačové zpracování dat, získaných difrakcí rtg záření na krystalu lektinu CV-IIL v komplexu s L-fukosyl-laktosou.

Abstract:

Thesis is focused on structure studies of lectin (carbohydrate binding protein) CV-IIL from bacteria Chromobacterium violaceum and glycosyltransferase rv3782 from bacteria Mycobacterium tuberculosis. It is divided into two parts. The first part attends to production, purification and crystallization of glycosyltransferase Rv3782 and second part targets the computational analysis of data, mined by X-ray diffraction on crystal of lectin CV-IIL in complex with L-fucosyl-lactose.

Klíčová slova

lektin, glykosyltransferasa, glykobiochemie, Chromobacterium violaceum, Mycobacterium tuberculosis, krystalografie, refinement

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 23. 5. 2007

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 22. 6. 2007
• Vedoucí: prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
• Oponent: doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biochemie / Biomolekulární chemie