Analysis of Risk Factors Associated with Dengue in Southeast Asia

Bc. Klára Urbanová

Master's thesis

Analýza rizikových faktorů spojených s dengue v Jihovýchodní Asii

Abstract:

Práce se zaměřuje na analýzu vztahů mezi rizikovými faktory a výskytem horečky dengue ve vybrané části Jihovýchodní Asie. Práce je konkrétně zacílena na Filipíny, jejíž vládní organizace poskytují relativně dostatečné množství dat. Na úvod je nastíněna obecná problematika tzv. zanedbaných tropických nemocí s podrobným zaměřením na horečku dengue, způsoby jejího šíření a ovlivňující faktory, včetně současných metod modelování vztahu mezi rizikovými faktory a výskytem horečky dengue. Praktická část se věnuje statistickému zpracování dostupných dat, zejména podrobné analýze vztahu mezi klimatickými faktory a výskytem dengue na Filipínách. Na základě obdržených poznatků je vytvořen matematický model popisující vztah mezi výskytem dengue, kumulativními srážkami a průměrnou teplotou na regionální a týdenní bázi. Odhad modelu je proveden pomocí zobecněné lineární regrese s využitím negativně binomického rozdělení. Pomocí modelu byla ověřena závislost incidence dengue na vybraných rizikových faktorech, ale také celková komplexnost rozvoje a šíření nemoci, kterou je nutné sledovat na regionální úrovni.

Abstract:

The thesis focuses on analyses of relations between risk factors and dengue fever incidence in a selected area of Southeast Asia region. Specifically, it focuses on the Philippines, where the governmental organizations provide relatively sufficient amount of data. First, general problematic of Neglected Tropical Diseases with focus on dengue fever is introduced. Its transmission and influencing factors are specified. Then, current methods of dengue incidence and risk factors relationship modelling are reviewed. Furthermore, statistical processing of available data is carried out, especially, in terms of detailed analysis of the relationship between climatic factors and dengue incidence in the Philippines. Based on the obtained results, a mathematical model describing the relationship between dengue, cumulative precipitation and mean temperature on regional and weekly basis, is created. Model estimation is performed with generalized linear regression by applying negative binomial distribution. With the model, the dengue incidence dependency on selected risk factors was verified. Concurrently, overall complexity of the disease development and transmission was verified by the model.

Keywords

Zanedbávané tropické nemoci, Zobecněné lineární modely, Rizikové faktory, dengue, Jihovýchodní Asie, Filipíny

Keywords

Dengue, Neglected Tropical Diseases, Southeast Asia, The Philippines, Risk factors, Generalized linear model

Language used: English

Date on which the thesis was submitted / produced: 17. 12. 2015

Thesis defence

• Supervisor: Mgr. Mgr. Miroslav Horák, Ph.D.
• Reader: Ivo Pavlík, CSc.

Mendel University in Brno

Faculty of Regional Development and International Studies

Master programme / field:
International Territorial Studies / International Development Studies