Použití metod strojového učení na automatickou segmentaci mikroskopických snímků.

Bc. Jan NOVÁČEK

Diplomová práce

Microscope image segmentation by means of machine learning methods.

Anotace:

Pro úlohu segmentace mikroskopických snímků jader buněk jsme navrhli a experimentálně ověřili novou metodu. Nejdříve jsme oddělili jádra buněk od pozadí pomocí prahování a následně jsme od sebe rozdělili jádra buněk, která tvořila klastry. Pro rozdělování klastrů jader buněk jsme využili konvoluční neuronové sítě, pomocí kterých se podařilo dosáhnout vysoké přesnosti. V teoretické části textu práce jsme popsali úlohu segmentace a vysvětlili jsme princip umělých neuronových sítí. Ve dvou závěrečných kapitolách jsme vysvětlili motivaci úlohy, princip nové metody a stručně jsme popsali implementaci ukázkového řešení.

Abstract:

For a microscope image segmentation task we developed and experimentally verified the new method. In a first step, we separated cell nuclei from the background by a thresholding and then we divided clusters of cell nuclei. For the cluster division we used convolutional neural networks by which the high accuracy was achieved. In the theoretical part, we described the segmentation task and also the core principle of artificial neural networks. In the two final chapters we explained the motivation of the task, principle of the new method a also implementation of sample solution was briefly described.

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 13. 5. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: RNDr. Eduard Bartl, Ph.D.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Informatika / Informatika