Druhová identifikace u Lepidopter pomocí jaderných genů WG a PER

Bc. Michaela Liškutinová

Master's thesis

Lepidoptera species identification using nuclear genes WG and PER

Abstract:

Diplomová práce se zabývá ověřením, zda jsou jaderné geny WG a PER vhodné pro druhovou identifikaci řádu Lepidoptera, čeledi Sphingidae. Prostřednictvím molekulárně-genetických metod byla získána data, která byla vyhodnocena prostřednictvím programů SeqScape Software v2.7, ClustalW, MEGA11 a databáze BLAST. Získaná data byla porovnána s dostupnými výsledky druhové identifikace čeledi Sphingidae prostřednictví mitochondriálního markeru cytochrom oxidázy podjednotky 1. Při srovnání bylo zjištěno, že mitochondriální marker COI je pro identifikaci jednotlivých druhů vhodnější vzhledem k možné degradaci DNA vlivem stáří u analyzovaných muzejních vzorků.

Abstract:

The diploma thesis deals with the verification of whether the nuclear genes WG and PER are suitable for species identification of the order Lepidoptera, family Sphingidae. Using molecular genetic methods, data were obtained and evaluated using SeqScape Software v2.7, ClustalW, MEGA11 and the BLAST database. The obtained data were compared with the available results of species identification of the family Sphingidae by means of the mitochondrial marker cytochrome oxidase subunit 1. In comparison, it was found that the mitochondrial marker COI is more suitable for the identification of individual species due to the possible degradation of DNA due to age in the analyzed museal samples.

Keywords

PER, COI, taxonomie, WG, fylogenetika, Lepidoptera, Sphingidae

Keywords

COI, WG, PER, taxonomy, phylogenetics, Lepidoptera, Sphingidae

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 4. 5. 2022

Thesis defence

• Date of defence: 1. 6. 2022
• Supervisor: prof. RNDr. Aleš Knoll, Ph.D.
• Reader: Michaela Nesvadbová, Ph.D.

Mendel University in Brno

Faculty of AgriSciences

Master programme / field:
Animal Breeding / Animal Biotechnology