Metody studia telomerových proteinů rostlin

Bc. Karin Anteková

Bakalářská práce

Methods of analysis of plant telomeric proteins

Abstract:

In this thesis we focused on the summary of knowledge about the structure of telomeres, proteins associated with telomeres in mammals and plants, and importance of telomeres for cell stability. In the next section methodological approaches used for identification of proteins bound to telomeric DNA were described. In the practical part we prepared material for newly introduced method PICh, which could be used for identification of plant telomeric proteins in vivo. We optimized sonication of chromatin isolated from leaves of a model plant Nicotiana tabacum. The second task was optimization of the TALE, which is planned to be used for visualization of telomeric repeats in tabaco cell culture TBY-2. In the discussion, we reported the possible cause of a failed transformation of cells TBY-2 cells by telomeric TALE constructs and our plants for future experiments.

Abstract:

V této bakalářské práci jsme se zaměřili na shrnutí poznatků o struktuře telomer, o proteinech asociovaných s telomerami u savců a rostlin, a vyzdvihnutí jejich důležitých funkcí v organismu. V další části práce jsou charakterizovány různé metodické přístupy služící k identifikaci proteinů vážících se na telomerovou DNA. V praktické části jsme se podíleli na přípravě materiálu pre nově zaváděnou metodu PICh, která by měla vést k identifikaci rostlinných telomerových proteinů in vivo. Součastí přípravy materiálu byla optimalizace sonikace chromatinu izolovaného z listů modelové rostliny Nicotiana tabacum. Druhým cílem byla optimalizace kroků metody TALE, která byla plánována pro vizualizaci telomerových repetitivních sekvencí v tabákové buněčné kultuře TBY-2. V diskusi jsme rozebrali možné příčiny neúspešných transformací bunek TBY-2 telomerovými konstrukty TALE a budoucí plány pro pozitivní výsledky dalších experimentů.

Klíčová slova

telomera, telomere, telomerové proteiny, telomeric proteins, chromatin, PICh, TALE

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 10. 5. 2016

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 14. 6. 2016
• Vedoucí: doc. Mgr. Miloslava Fojtová, CSc.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie