Dynamické sledování a evaluace geometrických vlastností cévního systému v závislosti na tlakovém namáhání

Tereza Muchová

Master's thesis

Dynamical Tracking and Evaluation of Blood Vessel System Geometrical Features Depending on Pressure Strain

Abstract:

Cílem této diplomové práce je návrh automatizovaných procedur pro detekci geometrických parametrů z video signálu a modelování dynamiky cévního systému v průběhu tlakového namáhání. V rámci analýzy jsou diskutovány dva variabilní přístupy pro detekci zájmových objektů z videa. Jedná se o algoritmus, který na základě barevných markerů detekuje tloušťku aorty a metodu, která umožňuje sledování distribuce tloušťky aorty v celé její délce, včetně dalších geometrických parametrů, které jsou realizovány v prostředí MATLAB. Následně jsou tyto metody porovnány s cílem vyhodnocení efektivity algoritmů. Dále je zhodnocena efektivita předzpracování obrazu v případě modelu distribuce tloušťky aorty. Kromě prezentování vývoje algoritmu jsou v této práci popsány mechanické vlastnosti cévního systému, principy sledování geometrických vlastností nebo algoritmy pro extrakci parametrů. Následně je provedena signálová analýza, která testuje signifikance variability signálu pro variabilní úseky aorty a statistická analýza, zahrnující deskriptivní statistiku, dvouvýběrové testování mediánu hodnot pomocí Wilcoxonova testu a vícevýběrové testování provedené Kruskal-Wallisovým testem.

Abstract:

The aim of this diploma thesis is the design of automated procedures for the detection of geometric parameters from a video signal and modeling the dynamics of the vascular system during compressive stress. Within the analysis, two variable approaches for the detection of objects of interest from video are discussed. It is an algorithm that detects aortic thickness based on color markers and a method that allows monitoring the distribution of aortic thickness along its entire length, including other geometric parameters that are implemented in MATLAB. Subsequently, these methods are compared in order to evaluate the efficiency of algorithms. Furthermore, the efficiency of image preprocessing in the case of the aortic thickness distribution model is evaluated. In addition to presenting the development of the algorithm, this work describes the mechanical properties of the vascular system, the principles of monitoring geometric properties or algorithms for parameter extraction. Subsequently, signal analysis is performed to test the significance of signal variability for aortic variable regions and statistical analysis, including descriptive statistics, two-sample testing of median values using the Wilcoxon test, and multi-sample testing performed by the Kruskal-Wallis test

Keywords

Aorta, video, detekce, geometrické parametry, zpracování obrazu, Skeleton metoda, metoda detekce barvy, MATLAB

Keywords

Aorta, video, detection, geometric parameters, image processing, Skeleton method, color detection method, MATLAB

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 30. 4. 2020

Thesis defence

• Date of defence: 26. 6. 2020
• Supervisor: Jan Kubíček
• Reader: Michal Dembowski

VSB – Technical University of Ostrava

Fakulta elektrotechniky a informatiky

Master programme / field:
Elektrotechnika / Biomedicínské inženýrství