Bc. Martin Stropek

Bakalářská práce

Computer-aided processing of metabolic reactions

Computer-aided processing of metabolic reactions
Anotace:
Cílem této práce je představit "Automated Reaction Mapping". Jedná se o důležitou součást mnoha aplikací systémové biologie. "Reaction Mappings" lze získat detailním zpracováním biochemických reakcí. Jsou nezbytné pro takzvané "consistency checking" metody a metabolické inženýrství. Výsledkem práce je kompletní analýza algoritmů pro výpočet "Atom Mappings" spolu s jejich srovnáním a příslušným hodnocením …více
Abstract:
The main goal of this thesis is to present the automated reaction mapping as an important tool for many applications in system biology. As a product of detailed processing of biochemical reactions, the atom mappings are an essential part of consistency checking methods and metabolic engineering. The thesis provides complete analysis of metrics developed to compute atom mappings along with the comparison …více
 

Keywords

atom mapping automated reaction mapping edit-distance minimization MetaCyc Synechocystis sp. PCC 6803 e-cyanobacterium.org CyanoTeam
 
Jazyk práce: angličtina
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 20. 5. 2013
Identifikátor: https://is.muni.cz/th/m4lhw/

Obhajoba závěrečné práce

  • Obhajoba proběhla 18. 6. 2013
  • Vedoucí: RNDr. David Šafránek, Ph.D.
  • Oponent: Ing. Matej Lexa, Ph.D.

Citační záznam

Citovat tuto práci

Plný text práce

Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:
  • světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatiky
Složka Odkaz na adresář do lokálního úložiště instituce