Nové markery pro detekci minimální reziduální choroby u karcinomu plic

Bc. Monika VAHALÍKOVÁ

Master's thesis

Novel markers for minimal residual disease detection in lung cancer

Abstract:

Karcinom plic je celosvětově nejrozšířenějším typem nádorového onemocnění, proto se neustále hledají nové potenciální markery pro jeho přesnější diagnostiku. Detekce minimální reziduální choroby (MRD) pomocí Real-time reverzně transkriptázové PCR je stále považována za "zlatý standard" v klinických vyšetřovacích metodách. MRD rozumíme přítomnost izolovaných nádorových buněk v těle pacienta, u něhož byl odstraněn primární tumor, a který nejeví známky systémového onemocnění. Cílem této studie bylo zjistit vztah míry exprese markerů LunX a c-met k celkovému přežití pacientů s NSCLC a navrhnout, optimalizovat a ověřit vhodnost nového markeru PTPRJ pro detekci MRD u plic pomocí Real-time PCR. Zaznamenali jsme statisticky významnou závislost mezi mírou exprese c met v krvi z plicní žíly a klinickým stádiem a postižením lymfatických uzlin. Dále jsme prokázali signifikantně kratší dobu přežití pacientů s expresí c-met v krvi a kostní dřeni. V případě markeru LunX nebyla prokázána statisticky významná závislost celkového přežití pacientů na míře jeho exprese. Dále jsme navrhli a zoptimalizovali real-time RT-PCR pro marker PTPRJ. Otestovali jsme jeho expresi ve vzorcích krve a kostní dřeně zdravých dárců a stanovili cut-off hodnoty v krvi a kostní dřeni. Vyšetřili jsme expresi PTPRJ ve vzorcích tumorů různého histogenetického původu a u několika vzorků krve pacientů s karcinomem plic. Zjistili jsme, že PTPRJ není vhodným markerem pro detekci MRD ve vzorcích krve a kostní dřeně u pacientů s NSCLC.

Abstract:

Lung cancer is the most frequently occurring cancer disease in the world therefore constantly looking for new potential biomarkers for the accurate diagnosis. Detection of minimal residual disease (MRD) by real-time reverse transcriptase PCR is still considered the "gold standard" in clinical diagnostic method. MRD means the presence of isolated tumour cells in the body of patient, who underwent curative surgery and is without any signs of cancer systemic spreading. The aim of this study was to determine the relationship of the level of LunX and c met markers expression and the overall survival of pacients with NSCLC and to design, optimize and verify the suitability of new marker PTPRJ for the detection of MRD in lungs by Real-time PCR. We have noted a statistically significant relationship between the level of c met expression in the pulmonary blood and the clinical stage and the lymph node involvement. Furthermore, we have demonstrated a significantly shorter survival of patients with c-met expression in the blood and bone marrow. In the case of marker LunX it has not been established statistically significant correlation of overall survival of patients with the level of LunX expression. In addition, we have designed and optimized the Real-time RT-PCR for marker PTPRJ. We have tested its expression in blood and bone marrow of healthy donors and set the cut-off values in the blood and bone marrow. We have investigated the expression of PTPRJ in tumor samples of different histogenetic origins and in several blood samples of patients with lung cancer. We have found that PTPRJ is not suitable marker for MRD detection in samples of the blood and bone marrow of patients with NSCLC.

Keywords

karcinom plic, minimální reziduální choroba, celkové přežití, real-time RT-PCR, markery LunX, c-met, PTPRJ

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 28. 4. 2014

Accessible from:: 28. 4. 2014

Thesis defence

• Supervisor: Mgr. Andrea Benedíková

PALACKÝ UNIVERSITY IN OLOMOUC

Faculty of Science

Master programme / field:
Biology / Molecular and Cell Biology