Diagnostika dědičných metabolických poruch pomocí LC-MS/MS

Stanislava PAVLÍKOVÁ

Bachelor's thesis

Diagnosis of inherited metabolic disorders using LC-MS/MS

Anotácia:

Dědičné metabolické poruchy (DMP) jsou onemocnění způsobená mutacemi v DNA. Důsledkem mutace nejčastěji vzniká nefunkční protein, který nemůže plnit svou funkci, což má negativní dopad na celý organismus. Nejčastěji postiženými proteiny jsou enzymy, jejichž poškození může způsobit jednak hromadění látek, které mohou být pro organismus toxické, nebo nedostatek látek pro organismus esenciálních. Tyto poruchy jsou často nevyléčitelné a léčba spočívá pouze v mírnění projevů a příznaků. Cílem experimentální části práce bylo vyvinout a validovat metodu pro diagnostiku vybraných DMP. Vzorky močí byly analyzovány pomocí kapalinové chromatografie ve spojení s tandemovou hmotnostní spektrometrií. Detekce celkem 32 markerů DMP probíhala v negativním módu na základě skenování produktů rozpadu molekulárního iontu. Do metody byly zařazeny především látky purinového, pyrimidinového a kreatinového metabolismu. Byla provedena validace metody a aplikace na reálné vzorky močí. Metoda byla uvedena do rutinního provozu v Laboratoři dědičných metabolických poruch Oddělení klinické biochemie ve Fakultní nemocnici Olomouc.

Abstract:

Inherited metabolic disorders (IMD) are diseases caused by DNA mutation. The mutation often results in defective protein that does not function properly, it has a negative effect on the organism. The most frequently affected proteins are enzymes and their damage can cause either accumulation of toxic substances or lack of essential metabolites. IMD are often incurable and the treatment offers only reduction of symptoms and manifestation. The aim of experimental part was to develop and validate a method for diagnosis of selected IMD. The urine samples were analyzed using liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry. Detection of 32 markers of IMD proceeded in a negative mode using multiple reaction monitoring mode. Metabolites of purine, pyrimidine and creatine metabolism were mainly included into the method. The validation and also the application of the method on real urine samples were performed. Nowadays the method has been used in a routine practice in the Laboratory for Inherited Metabolic Disorders, Department of Clinical Biochemistry, Medical Hospital in Olomouc.

Kľúčové slová

Dědičné metabolické poruchy, kapalinová chromatografie, tandemová hmotnostní spektrometrie, purinové a pyrimidinové látky, validace

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 6. 5. 2013

Zverejniť od: 6. 5. 2013

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 10. 6. 2013
• Vedúci: Mgr. Hana Janečková

PALACKÝ UNIVERSITY IN OLOMOUC

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biochemistry / Biochemistry