Konformace cukrfosfátové páteře a deoxyribózy v protein-DNA komplexech. – Bc. Filip ČERNÝ
Bc. Filip ČERNÝ
Diplomová práce
Konformace cukrfosfátové páteře a deoxyribózy v protein-DNA komplexech.
Conformation of sugar-phosphate backbone and deoxyribose in protein-DNA complexes.
Anotace:
Pomocí molekulární dynamiky (MD) je možné počítat Gibbsovu energii, predikovat vývoj molekulárních systémů v čase nebo simulovat vazbu ligandu do vazebného místa proteinu. Proto, abychom obdrželi co nejpřesnější výsledky, je nutné mít silové pole, které správně popisuje dané systémy. Tato práce se zaměřuje na ověřování kvality silových polí pro modelování nukleových kyselin v MD simulacích a konkrétně …víceAbstract:
Molecular dynamics (MD) modeling can be used to calculate Gibbs energy, to predict the evolution of a molecular system over time or t simulate the binding of a ligand to the active site of a protein. For accurate molecular dynamics results, it is necessary to have a force field that describes the systems correctly. This work is focused on verification of quality of the force field used to model nucleic …více
Jazyk práce: čeština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 29. 4. 2022
Obhajoba závěrečné práce
- Vedoucí: doc. RNDr. Petr Jurečka, Ph.D.
Citační záznam
Jak správně citovat práci
ČERNÝ, Filip. Konformace cukrfosfátové páteře a deoxyribózy v protein-DNA komplexech. . Olomouc, 2022. diplomová práce (Mgr.). UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI. Přírodovědecká fakulta
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI, Přírodovědecká fakultaUNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
Přírodovědecká fakultaMagisterský studijní program / obor:
Fyzika / Molekulární biofyzika
Práce na příbuzné téma
-
Studium molekulových interakcí v nukleových kyselinách: (deoxy)ribosa-báze a fosfát-báze
Klaudia Mráziková -
Předpověď struktur multiprvkových kovových vrstev vytvářených atom po atomu pomocí klasické molekulární dynamiky
Pavla MACHÁŇOVÁ -
Vliv silného elektrického pole na strukturu polymerů ve vodných roztocích
Šárka DĚDIČOVÁ
Název
Vložil
Vloženo
Práva