Lipidomická analýza cerebrospinální tekutiny transgenních potkanů s tauopatií

Mgr. Lenka KOCUROVÁ

Diplomová práce

Lipidomic analysis of cerebrospinal fluid from transgenic rats with tauopathy

Anotace:

Alzheimerova choroba je nejčastější příčinou demence v populaci a zároveň nejčastější tauopatií. Onemocnění je charakteristické ukládáním hyperfosforylovaných a zkrácených tau proteinů ve formě neurofibrilárních klubek v neuronech a gliích. Cílem práce byla lipidomická analýza vzorků mozkomíšního moku kontrolních a transgenních potkanů s tauopatií za účelem nalezení nových potenciálních biomarkerů tauopatického procesu. Byl využitý přístup cílené lipidomické analýzy technikou vysokoúčinné kapalinové chromatografie na reverzní fázi ve spojení s tandemovou hmotnostní spektrometrií. Celkem bylo identifikováno 394 lipidů z kategorií acylů mastných kyselin, glycerolipidů, glycerofosfolipidů a sfingolipidů. Na základě diskriminační analýzy pomocí ortogonální projekce do latentních struktur byly zjištěny nejvýznamnější rozdíly mezi skupinami transgenních a kontrolních vzorků u sfingomyelinů, fosfatidylcholinů a ethericky vázaných fosfatidylcholinů.

Abstract:

Alzheimer's disease is the most common cause of dementia in the population and the most common tauopathy. The disease is characterized by the deposition of hyperphosphorylated and truncated tau proteins in the form of neurofibrillary tangles located in neurons and glial cells. Lipidomic analysis of cerebrospinal fluid samples of control and transgenic rats with tauopathy was performed with the aim to find new potential biomarkers of pathological process of tauopathy. Targeted lipidomic approach was chosen using reversed phase high performance liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry. There were 394 lipids identified from the lipid categories of fatty acyls, glycerolipids, glycerophospholipids and sphingolipids. According to orthogonal partial least squares discriminant analysis, the most significant differences between the groups of transgenic and control samples were found in the following lipid classes: sphingomyelins, phosphatidylcholines, and ether-linked phosphatidylcholines.

Klíčová slova

Alzheimerova choroba, tauopatie, tau protein, lipidomika

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 27. 5. 2020

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 19. 6. 2020
• Vedoucí: Mgr. Štěpán Kouřil

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie