Analýza nádorového supresporu p53 u hematoonkologických onemocnění myeloidní řady

Bc. Kristýna Adamcová

Master's thesis

Analysis of tumor suppressor p53 in hematooncological diseases of myeloid lineage

Anotácia:

Akutní myeloidní leukémie je závažné maligní onemocnění, s velmi rychlým průběhem. Mutace genu TP53 jsou spojeny s patogenezí části případů tohoto onemocnění a jsou významným prognostickým faktorem. Pacienti s mutací genu TP53 jsou rezistentní ke konvenční léčbě a mají kratší dobu přežití oproti pacientům bez této mutace. V rámci této práce byl na souboru pacientů s AML analyzován status genu TP53 pomocí metody FASAY. Mutace TP53 byly identifikovány u 18,1 % pacientů s AML. Mutace byly následně dále analyzovány, byl posouzen jejich výskyt ve vztahu k morfologickým, klinickým a cytogenetickým parametrům a byl zhodnocen vliv jejich přítomnosti na prognózu pacientů. Při analýze mutací TP53 byly s vysokou frekvencí (40 %) detekovány teplotně-senzitivní mutace, které byly následně porovnávány s ostatními mutacemi TP53. V průběhu práce byla zavedena a optimalizována nová metoda PCR přímo z lyzovaných kvasinkových kolonií, která přispěla k rychlejší analýze mutací TP53. Na závěr práce je diskutováno navýšené pozadí červených kolonií u metody FASAY detekované v jednom z 3 souborů pacientů.

Abstract:

Acute myeloid leukemia is a serious malignant disease with very fast process. TP53 mutations are associated with the pathogenesis of cases of the disease and they are an important prognostic factor. Patients with mutations in the TP53 gene are resistant to conventional treatment and outlive shorter than patients without the mutation. In this work, the status of the TP53 gene was analyzed in the group of patients with AML, using method FASAY. TP53 mutations were identified in 18.1% of patients with AML. Mutations were then further analyzed to assess their occurrence in relation to morphological, cytogenetic and clinical parameters and the effect of their presence on the prognosis of patients was evaluated. During analysis of TP53, mutations were with high frequency (40 %) detected via the temperature – sensitive mutations, which were subsequently compared with other TP53 mutations. During the work a new method PCR directly form lysed yeast colonies was estabilished and optimized, which contributed to faster analysis of TP53 mutations. At the conclusion, the increased background of red colonies in method FASAY detected in one of three sets of patiens is discussed.

Kľúčové slová

AML, MDS, FASAY, teplotně-senzitivní mutace, TP53

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 13. 5. 2013

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 10. 6. 2013
• Vedúci: Mgr. Šárka Pavlová, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Experimental Biology / Molecular Biology and Genetics