Zpět na vyhledávání

Adela MIKEŠOVÁ

Bachelor's thesis

\kur{De novo} sekvenování genomu \kur{Crenicichla semifasciata} technologií Oxford Nanopore

Abstract:
The submitted bachelor thesis deals with de novo sequencing of genome of the cichlid species Crenicichla semifasciata on the Oxford Nanopore platform and its assembly with the Flye algorithm. The study further investigates the influence of sequencing depth on the BUSCO completeness assessment and N50 metrics of the obtained assembly.
Abstract:
The submitted bachelor thesis deals with de novo sequencing of genome of the cichlid species Crenicichla semifasciata on the Oxford Nanopore platform and its assembly with the Flye algorithm. The study further investigates the influence of sequencing depth on the BUSCO completeness assessment and N50 metrics of the obtained assembly.
 

Keywords

MinION kompletnost BUSCO adaptivní radiace dlouhé sekvence
 
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 13. 4. 2022

Thesis defence

  • Supervisor: RNDr. Ing. Lubomír Piálek, Ph.D.

Citation record

Cite this text
The right form of listing the thesis as a source quoted

MIKEŠOVÁ, Adela. \kur{De novo} sekvenování genomu \kur{Crenicichla semifasciata} technologií Oxford Nanopore. České Budějovice, 2022. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH, Přírodovědecká fakulta
http://wstag.jcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=62471 Reference to the local database file of the institution

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biology / Biomedical Laboratory Techniques

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.
  • No theses on a related topic available.
 
Name
Posted by
Uploaded/Created
Rights
Theses 7oztg8 7oztg8/2
13/4/2022
Folders
Files
thesis Mikesova_Adela_2022_BP.pdf
Bulánová, L.
14/4/2022

  • Co je jinak přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Co je jinak další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Co je jinak pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Co je nové vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Co je nové rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.

  • Co se chystá

    Připravujeme další vylepšení pro mobilní zařízení.