Adela MIKEŠOVÁ

Bachelor's thesis

\kur{De novo} sekvenování genomu \kur{Crenicichla semifasciata} technologií Oxford Nanopore

Anotácia:
The submitted bachelor thesis deals with de novo sequencing of genome of the cichlid species Crenicichla semifasciata on the Oxford Nanopore platform and its assembly with the Flye algorithm. The study further investigates the influence of sequencing depth on the BUSCO completeness assessment and N50 metrics of the obtained assembly.
Abstract:
The submitted bachelor thesis deals with de novo sequencing of genome of the cichlid species Crenicichla semifasciata on the Oxford Nanopore platform and its assembly with the Flye algorithm. The study further investigates the influence of sequencing depth on the BUSCO completeness assessment and N50 metrics of the obtained assembly.
 

Kľúčové slová

MinION kompletnost BUSCO adaptivní radiace dlouhé sekvence
 
Jazyk práce: Czech
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 13. 4. 2022

Obhajoba závěrečné práce

  • Vedúci: RNDr. Ing. Lubomír Piálek, Ph.D.

Citační záznam

Citovat tuto práci
Jak správně citovat práci

MIKEŠOVÁ, Adela. \kur{De novo} sekvenování genomu \kur{Crenicichla semifasciata} technologií Oxford Nanopore. České Budějovice, 2022. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Plný text práce

Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:
  • světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH, Přírodovědecká fakulta
http://wstag.jcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=62471 Odkaz na soubor do lokálního úložiště instituce

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biology / Biomedical Laboratory Techniques

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
  • Žádné práce na příbuzné téma.
 
Názov
Vložil
Vložené
Práva
Theses 7oztg8 7oztg8/2
13. 4. 2022
Složky
Soubory
thesis Mikesova_Adela_2022_BP.pdf
Bulánová, L.
14. 4. 2022

  • Co je jinak přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Co je jinak další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Co je jinak pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Co je nové vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Co je nové rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.

  • Co se chystá

    Připravujeme další vylepšení pro mobilní zařízení.