Screening izolovaných nebo nově vyvinutých biokatalyzátorů s vysokou stabilitou a aktivitou in vitro a in vivo

Mgr. Petra Szelcsányiová

Bachelor's thesis

Screening of isolated or newly developed biocatalysts with high stability and activity in vitro and in vivo

Anotácia:

Screeningové metody jsou nezbytnou součástí moderního výzkumu biomolekul. Cílem vědců je objevit takovou metodu, která bude rychlá, cenově přijatelná, časově a metodicky nenáročná a v neposlední řadě dostatečně účinná. Bakalářská práce obsahuje popis základních metod vhodných ke stanovení aktivity a stability enzymů a navrhuje optimální techniky pro testování halogenalkandehalogenas. První tři kapitoly se věnují obecné charakteristice enzymů a halogenalkandehalogenasam - bakteriálním enzymům schopným štěpit chemickou vazbu uhlík-halogen širokého spektra alifatických halogenovaných sloučenin. V dalších kapitolách jsou popsány screeningové metody systematicky rozdělené do šesti skupin: spektrometrické metody, metody založené na hmotnostní spektrometrii, elektroforetické metody, imunologické metody, metody založené na genové expresi a metody „fingerprintu“. V poslední kapitole jsou popsány techniky vhodné pro sledování požadovaných vlastností halogenalkandehalogenas. V závěru jsou shrnuty a diskutovány výhody a nevýhody jednotlivých metod a možnosti jejich praktického využití.

Abstract:

Screening methods represent important part of modern biomolecular reseach. The aim of many scientists is to discover sophisticated, cheap, fast and simple method for determinination of enzyme activity and stability. This bachelor thesis includes description of basic methods for determinination protein stability and activity and suggests optimal techniques for testing of haloalkane dehalogenases. Initial three chapters summarize general characteristics of enzymes and haloalkane dehalogenases - bacterial enzymes which catalyze hydrolytic cleavage of carbon-halogen bond in a wide range of halogenated aliphatic compounds. Following chapters describe screening methods systematically divided into six groups: spectrometric methods, mass spectrometry methods, electrophoretic methods, imunology methods, methods based on gene expression and fingerprinting methods. In the last chapter, appropriate methods for determination of target properties of haloalkane dehalogenases are described. Finally the advantages and disadvantages of each method are summarized and discussed with attention to their practical applications.

Kľúčové slová

Halogenalkandehalogenasy, enzymy, screeningové metody, aktivita, stabilita, Haloalkane dehalogenases, enzymes, screening methods, activity, stability

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 5. 2012

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 19. 6. 2012
• Vedúci: doc. Mgr. Radka Chaloupková, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biology / General Biology