Taxonómia a diverzita kozmopolitnej sinice Microcoleus

Bc. Viktória DODOKOVÁ

Master's thesis

Taxonomy and diversity of the cosmopolitan cyanobacterium Microcoleus

Abstract:

Sinice predstavujú veľkú skupinu prokaryotických organizmov, ktoré sú schopné produkovať kyslík prostredníctvom fotosyntézy. Vyskytujú sa v sladkovodnom i morskom prostredí, pôde, skalách ale často prežívajú aj v extrémnych podmienkach, ako sú púšte či polárne oblasti. Taxonómia siníc je tradične založená na morfológii, avšak s príchodom genetických informácií sa považuje za neplatnú. Morfologická variabilita je v porovnaní s genetickou omnoho menšia. Sinica Microcoleus je kozmopolitne rozšíreným druhom a vyskytuje sa predovšetkým v pôde. Taxonómia siníc je komplikovaná a stále málo preskúmaná. Cieľom diplomovej práce je priniesť nové poznatky v taxonómii sinice rodu Microcoleus. Vo výskumnej časti bolo použitých 35 kmeňov, ktoré boli podrobené morfologickej a fylogenetickej analýze. Vo fylogenetickej analýze bola použitá sekvencia génu 16S rRNA. Na základe genetickej analýzy bolo definovaných 8 skupín, ktoré boli priradené k 5 už existujúcim druhom rodu Microcoleus.

Abstract:

Cyanobacteria are a large group of prokaryotic organisms that are able to produce oxygen through photosynthesis. They occur in freshwater and marine environments, soil, rocks, but often survive in extreme conditions, such as deserts or polar areas. The taxonomy of cyanobacteria has traditionally been based on morphology, but with the new genetic information it is considered invalid. Morphological variability is much smaller compared to genetic variability. The cyanobacterium Microcoleus is a cosmopolitan species and occurs primarily in soil. The taxonomy of cyanobacteria is complicated and still poorly understood. The aim of the thesis is to bring new knowledge in the taxonomy of the cyanobacteria genus Microcoleus. In the research part, 35 strains were used, which were subjected to morphological and phylogenetic analysis. In the phylogenetic analysis was used the 16S rRNA gene sequence. On the basis of genetic analysis, 8 groups were defined, which were assigned to 5 already existing species of the genus Microcoleus.

Keywords

Microcoleus, sinice, taxonómia, fylogenéza, morfológia

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 24. 7. 2023

Thesis defence

• Supervisor: doc. Mgr. Petr Dvořák, Ph.D.

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Master programme / field:
Hydrobiology / Hydrobiology