Analýza karyotypu cíceru baranieho (Cicer arietinum L.)

Bc. Lucia SLÁDEKOVÁ

Master's thesis

Karyotype analysis of chickpea (Cicer arietinum L.)

Anotácia:

Predložená diplomová práca sa zaoberá analýzou karyotypu hospodársky významných kultivarov cíceru baranieho - Desi a Kabuli s využitím najnovších cytogenetických metód. Teoretická časť práce pojednáva o súčasnej problematike, všeobecnej a cytogenetickej charakterizácii cíceru, popisuje molekulárne a cytogenetické prístupy analýzy karyotypu u rastlín. V experimentálnej časti práce boli identifikované jednotlivé chromozómy oboch kultivarov metódou oligo-maľovania, ktorá nebola doposiaľ u cíceru použitá. Táto technika sa preukázala u cíceru ako funkčná a dostatočne citlivá k odhaleniu prestavby karyotypu vrámci druhu a tiež chýb v orientácii a zostave referenčných pseudomolekúl. Za účelom detailnejšej analýzy boli tiež mapované, v minulosti už lokalizované sekvencie, ktoré spoľahlivosť oligo-maľovacieho systému u cíceru potvrdili.

Abstract:

The presented master thesis deals with the analysis of the karyotype of economically important cultivars of chickpea - Desi and Kabuli using the latest cytogenetic methods. The theoretical part deals with current issues, general and cytogenetic characterization of chickpea, describes molecular and cytogenetic approaches to karyotype analysis in plants. In the experimental part of the work, the individual chromosomes of both cultivars were identified by the oligo-painting method, which has not been used in chickpea. This technique has been shown in chickpea to be functional and sensitive enough to detect karyotype rearrangement within a species, as well as errors in the orientation and assembly of reference pseudomolecules. For a more detailed analysis, sequences already localized in the past were also mapped, which confirmed the reliability of the oligopainting system in chickpea.

Kľúčové slová

cytogenetika, oligo-maľovanie, fluorescenčná in situ hybridizácia, karyotyp, BAC klony, cícer

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 22. 4. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Vedúci: Mgr. Alžběta Němečková

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biology / Molecular and Cell Biology