Webová aplikace pro analýzu dat z databáze bio.tools

Bc. Dan Polanský

Bachelor's thesis

Web application for analysis of bio.tools data

Anotácia:

V rámci evropského projektu ELIXIR byla vytvořena unikátní databáze bioinformatických nástrojů bio.tools, která se, na rozdíl od jiných podobných databází, zaměřuje hlavně na formální anotaci funkcí jednotlivých nástrojů. Tyto funkce popisuje ontologie EDAM. Práce navrhuje a implementuje webovou aplikaci, která bude přehledně zobrazovat vybrané přehledy a nejdůležitější statistiky nad daty z databáze bio.tools získanými skrze API a informace o publikacích.

Abstract:

Within the European project ELIXIR, a unique database of bioinformatics tools called bio.tools was created. Bio.tools, unlike other similar databases, focuses mainly on the formal annotation of the functions of individual tools. These functions are described by the EDAM ontology. The thesis designs and implements a web application that will show selected reports and most important statistics from data obtained through bio.tools API and information about publications.

Kľúčové slová

bio.tools, webová aplikace, databáze bioinformatických nástrojů, bioinformatika, výpočetní biologie

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 18. 12. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 13. 2. 2018
• Vedúci: RNDr. Tomáš Raček
• Oponent: doc. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Informatics

Bachelor programme / odbor:
Applied Informatics / Applied Informatics