Molekulárně-biologická charakteristika fytoplazem ze skupiny žloutenky jilmu (16SrV) infikujících plevele na jižní Moravě

Barbara NARDELLIOVÁ

Bakalářská práce

Molecular and biological characterization of Elm yellows phytoplasmas (16SrV) infecting weeds of south Moravia

Anotace:

Fytoplazmy jsou bakteriální paraziti způsobující mnoho ekonomicky významných rostlinných chorob. Rostliny jsou infikovány prostřednictvím hmyzích vektorů. Fytoplazmy, jakož to intrabuněční paraziti, osídlují sítkovice rostlin a zabraňují tak transportu živin, což způsobuje vznik různých symptomů u rostlin. Vývoj taxonomie fytoplazem významně posunulo využití konzervovaného ribozomálního genu 16S rRNA při molekulárních analýzách. Cílem práce bylo charakterizovat a identifikovat fytoplazmy napadající plevele na jižní Moravě se zaměřením na skupinu žloutenky jilmu (16SrV). Druhy skupiny 16SrV jsou rozšířeny především v severní Americe a Evropě. Infikují hlavně dřeviny, případně keře, u kterých způsobují žloutenku a odumírání. Hlavním zástupcem skupiny je druh ´Candidatus Phytoplasma ulmi´, který infikuje zejména jilmy. Za hlavní vektor v Evropě se považuje Macropsis mendax, v Severní Americe je to Scaphoideus luteolus. V experimentální části práce byly pomocí molekulárních metod analyzovány dva vzorky DNA izolované z pcháče osetu (Cirsium arvense (L.) Scop.) a svlačce rolního (Convolvulus arvensis L.). Výsledky získané sekvencováním úseku R16F2/R16R2 sekvence genu 16S rRNA potvrdily přítomnost fytoplazmy ´Candidatus Phytoplasma mali´ (16SrX-A) u vzorku z pcháče a ´Candidatus Phytoplasma solani´ (16SrXII-A) u vzorku ze svlačce.

Abstract:

Phytoplasmas are bacterial parasites causing many economically important plant diseases. Plants are infected by insect vectors. Phytoplasmas, intracellular parasites, inhabit sieve tubes in plants and prevent the transport of nutrients, causing the formation of different symptoms in plants. Development of phytoplasmas taxonomy shifted the use of conserved ribosomal 16S rRNA gene for molecular analyzes significantly. The aim was characterization and identification of phytoplasmas infecting weeds in south Moravia, focusing on a group of elm yellows (16SrV). Types of groups 16SrV are spread mainly in North America and Europe. They infect mainly trees or shrubs, for which they cause yellows and death. The main representative of the group is a kind of 'Candidatus phytoplasma ulmi', which mainly infects elms. Macropsis mendax is considered as the main vector in Europe, Scaphoideus luteolus in the North America. In the experimental part of this work two samples of DNA isolated from creeping thistle (Cirsium arvense (L.) Scop.) and bindweed (Convolvulus arvensis L.) were analyzed by molecular methods. The results obtained by sequencing section R16F2/R16R2 16S rRNA gene sequences confirmed the presence of phytoplasma 'Candidatus phytoplasma mali' (16SrX-A) in the sample of the creeping thistle and 'Candidatus phytoplasma solani' (16SrXII-A) in the sample of the convolvulus.

Klíčová slova

Fytoplazmy, Elm yellows phytoplasma, pcháč oset, Cirsium arvense, 16S rDNA

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 23. 7. 2012

Zveřejnit od: 23. 7. 2012

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: RNDr. Pavla Válová

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární a buněčná biologie