Využití molekulárních markerů pro taxonomické a fylogenetické analýzy u dvoukřídlého hmyzu (Diptera)

Mgr. Petr Bejdák

Bakalářská práce

Anotace:

Tato bakalářská práce se zabývá fylogenetickými analýzami dvoukřídlého hmyzu založenými na srovnávání sekvencí DNA. Zaměřuje se hlavně na sekvencování molekulárních markerů a jejich využití pro rekonstrukci fylogeneze. Molekulární marker je určitý úsek molekuly DNA, který je porovnáván u zkoumaných druhů. Zmíněny jsou i metody porovnávání sekvencí DNA bez použití sekvencování. Práce obsahuje přehled metod extrakce hmyzí DNA, PCR, sekvencování DNA a rekonstrukce fylogeneze ze sekvencí DNA. Jsou uvedeny jednotlivé markery používané pro dvoukřídlý hmyz a variabilita jejich sekvence u dané taxonomické skupiny. Podle variability se usuzuje na použití markerů na vyšší nebo nižší taxonomické úrovni. V praktické části je použita sekvence 16S rDNA pro fylogenetickou analýzu šesti druhů rodu Tachina: T. fera, T. magnicornis, T. nupta, T. ursina, T. lurida a T. grossa. Analýza potvrzuje rozdělení studovaných druhů do podrodů Servillia, Eudoromyia a Tachina podle tradiční taxonomie a podporuje blízkou příbuznost druhů T. magnicornis a T. nupta.

Abstract:

This work reviews phylogenetic analyses in the insect order Diptera based on various molecular markers. Molecular marker is a part of DNA molecule which is compared among analyzed species. The most often, a part of DNA is sequenced and the sequences are used for phylogenetic reconstruction. However, also methods of comparing DNA fragments without sequencing are mentioned. Overview of DNA extraction methods from insect tissues, PCR, DNA sequencing, and methods of phylogeny reconstruction from DNA sequences are described. Variability of the molecular markers which have been used in phylogenetic studies of Diptera is compared and the usefulness of particular markers on various taxonomic levels is discussed. In the practical part, partial 16S rDNA sequences are used for phylogenetic analysis of six species of the genus Tachina: T. fera, T. magnicornis, T. nupta, T. ursina, T. lurida and T. grossa. The analysis confirms the traditional taxonomic dividing of the species under study into subgenera Servillia, Eudoromyia and Tachina. A close relationship between species T. magnicornis and T. nupta is well supported.

Klíčová slova

Molekulární marker, fylogeneze, taxonomie, Diptera, Tachina

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 5. 2006

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 27. 6. 2006
• Vedoucí: prof. RNDr. Jaromír Vaňhara, CSc.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární biologie a genetika