Lidský mykobiom a jeho vliv na zdraví

Bc. Paulína Belvončíková

Bachelor's thesis

Human mycobiome and its health effects

Abstract:

This bachelor thesis is specifically concerned with the composition of the human basal mycobiome and its impact on health. Human mycobiome makes up less than 1% of the complex ecosystem of our body's microorganisms. It interacts with other commensals of ecosystem, such as bacteria and archaea through synergistic and antagonistic relationships. Human mycobiome inhabits the oral cavity, gastrointestinal tract, respiratory tract, vagina, and skin. Its colonization begins right after the birth and it is influenced by several basic factors. These are gestational age of the newborn, birth weight, delivery method and whether the newborn is breast fed or fed by formula. During life, the composition of mycobiome is further influenced by a large number of endogenous and exogenous factors. The most important factors are diet, body weight, age, sex, antibiotic and antifungal therapy. Moreover, mycobiome stimulates innate and specific human immune responses. This process is done by recognizing individual species of microorganisms by immune receptors. In case of immunocompromised individuals, there might be a possibility of colonization of opportunistic pathogens or the overgrowth of common commensals, which do not pose any risk to a healthy person, however. It is currently known that mycobiome affect pathogenesis of inflammatory bowel diseases and respiratory tract diseases. The method of targered amplicon sequencing ITS1, ITS2 and 18S segments of eukaryotic ribosomal RNA gene or metagenome sequencing is used for its study.

Abstract:

Táto bakalárska práca sa venuje zloženiu bazálneho mykobiómu človeka a jeho vplyvu na zdravie. Ľudský mykobióm tvorí menej ako 1% z komplexného ekosystému mikroorganizmov osídľujúcich naše telo. Interaguje s ďalšími komenzálmi ekosystému, ako sú baktérie a archea, prostredníctvom synergických a antagonistických vzťahov. Ľudský mykobióm osídľuje ústnu dutinu, gastrointestinálny trakt, respiračný trakt, vagínu a pokožku. Jeho kolonizácia začína hneď po narodení a ovplyvňuje ju niekoľko základných faktorov. Sú nimi gestačný vek novorodenca, pôrodná váha, spôsob pôrodu a fakt či je novorodenec kojený alebo krmený umelou stravou. Počas života je zloženie mykobiómu ďalej ovplyvnené veľkým množstvom endogénnych a exogénnych faktorov. Najdôležitejšími faktormi sú strava, telesná hmotnosť, vek, pohlavie, antibiotická a antimykotická liečba. Mykobióm taktiež stimuluje vrodené a špecifické imunitné odpovede človeka. Deje sa tak prostredníctvom rozpoznávania jednotlivých druhov mikroorganizmov receptormi imunitných buniek. V prípade imunokompritovaných jedincov môže dochádzať ku kolonizácii oportúnnymi patogénami alebo premnoženiu bežných komenzálov, ktoré pre zdravého človeka nepredstavujú riziko. V súčasnosti vieme, že mykobióm ovplyvňuje patogenézu zápalových ochorení čriev a ochorení respiračného traktu. Na jeho štúdium sa využíva metóda sekvenovania úsekov ITS1, ITS2 a 18S eukaryotického génu pre ribozomálnu RNA alebo celometagenomové sekvenovanie.

Keywords

mykobióm, fungálny mikrobióm, huby, ústna dutina, gastrointestinálny trakt, respiračný trakt, vagína, pokožka, kolonizácia, faktory, imunita, zdravie, metódy, mycobiome, fungal microbiome, fungi, oral cavity, gastrointestinal tract, respiratory tract, skin, colonization, factors, immunity, health, methods

Language used: Slovak

Date on which the thesis was submitted / produced: 9. 5. 2019

Thesis defence

• Date of defence: 11. 6. 2019
• Supervisor: Mgr. Petra Vídeňská, Ph.D.
• Reader: MVDr. Marcela Faldynová, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Experimental Biology / Special Biology