Studium vybraných genových variant u chronické lymfocytární leukemie

Petra GREGOROVÁ

Bachelor's thesis

Study of selected genetic variants in chronic lymphocytic leukemia

Abstract:

Chronická lymfocytární leukémie (CLL) je nejčastější formou leukémie v západních zemích. CLL je lymfoproliferativní, maligní onemocnění s neznámou etiologií, které se vyznačuje velkou klinickou a genetickou heterogenitou. U pacientů s CLL bývají v 50 % přítomny genetické změny, mezi nejčastější patří delece del(13q), del(11q), del(17p), del(6q), trisomie 12 a další. Tato bakalářská práce se zabývá studiem expresních profilů vybraných molekul u pacientů s CLL s delecí na dlouhém raménku chromozómu 6 [del(6q)], která se vyskytuje u 7 % pacientů s CLL a bývá spojována s horší prognózou. U pacientů s del(6q) nebyl dosud studován expresní profil genů, které se nachází v minimální deletované oblasti na dlouhém raménku chromozómu 6. Tato bakalářská práce je proto zaměřena na studium mRNA / proteinové exprese vybraných molekul, které v této oblasti leží nebo s nimi souvisí. Konkrétně se tato práce zaměřuje na studium exprese genů FoxO3a, NF-KB, TBX21, IL-2 a BCL10. U souboru CLL pacientů s del(6q) a bez del(6q) a u kontrolních zdravých jedinců byla provedena kvantitativní PCR a bylo zjištěno, že nejvíce deregulovanými geny jsou FoxO3a a NF-B. U těchto genů byla pomocí metody Western blotting studována proteinová exprese a byla zjištěna zvýšená exprese FoxO3a i NF-KB proteinů u pacientů s CLL s del(6q). U molekul TBX21, IL-2 a BCL10 nebyl prokázán rozdíl mezi studovanými skupinami. Deregulace exprese transkripčních faktorů FoxO3a a NF-B může mít klíčový vliv na průběh onemocnění a horší prognózu CLL pacientů s del(6q) ve srovnání s CLL bez del(6q) a kontrolními jedinci a bude určitě předmětem dalšího studia.

Abstract:

Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is the most common leukemia in the western countries. CLL is a lymphoproliferative malignant disease with unknown etiology which is characterized by high clinical and genetic heterogeneity. In 50 % of CLL patients are genetic changes, such as deletion del(11q), del(17p), del(6q) and others. This thesis deals with the molecular characterisation of patients with CLL with deletion on the long arm of chromosome 6 (del(6q), which occurs in 7 % of patients with CLL. There is no gene expression profile study in patients with a deletion on the long arm of chromosome 6. This thesis is therefore focused on the study of mRNA / protein expression of selected molecules in minimal deleted region on the long arm of chromosome 6 in patients with CLL. Specifically, this work is focused on the study of gene expression FoxO3a, NF-KB, TBX21, IL-2 and BCL10. In a group of CLL patients with del(6q) and without del(6q), and control healthy subjects the gene expression profiling was performed using quantitative PCR, and it was found that genes FoxO3a and NF-KB were deregulated. The protein levels of these transcription factors were investigated by Western blotting. There was increased expression of FoxO3a and NF-kappa B proteins in CLL patients with del(6q) comparing to patients without del(6q). The deregulation of the expression of the aforementioned molecules FoxO3a and NF-KB could affect the course and prognosis of CLL patients with del(6q) and will be investigated in future studies.

Keywords

Chronická lymfocytární leukémie, delece na dlouhém raménku chromozómu 6, FoxO3a, NF-KB

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 28. 4. 2015

Accessible from:: 28. 4. 2015

Thesis defence

• Supervisor: Ing. Eva Kriegová, Dr.

PALACKÝ UNIVERSITY OLOMOUC

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biology / Molecular and Cell Biology