Genetická diverzita u vybraných rybích parazitů čeledi Gyrodactylidae (Monogenea)

Bc. Markéta Charousová

Bakalářská práce

Genetic diversity of selected fish parasites of family Gyrodactylidae (Monogenea)

Anotace:

Cílem Tato práce je zaměřená na biologii rybích parazitů rodu Gyrodactylus, jejich determinaci pomocí molekulárně-genetických metod, vyhledávání a zpracování dat, která jsou k nalezení v databázi GenBank. Zabývá se především ribosomální RNA, jejími komponentami 18S, ITS1, 5.8S, ITS2 a 28S a mitochondriální DNA, konkrétně COXI a COXII. Počet nalezených zástupců je 162 při celkovém počtu 2282 záznamů. Jmenný seznam zástupců s konkrétními výsledky je uveden v příloze. Na základě získaných poznatků je zřejmé, že u většiny zástupců je známá jejich ribosomální sekvence, u 25 zástupců, je pak známá i sekvence mitochondriální DNA, z toho u tří je pak osekvenovaný celý cirkulární mitochondriální genom.

Abstract:

This work is focused on biology of fish parasites gender Gyrodactylus, their determination by molecular-genetic methods, seeking and processing data that are available in GenBank database. Its main focus is on ribosomal RNA, its components 18S, ITS1, 5.8S, ITS2 and 28S, and mitochondrial DNA especially COXI and COXII. The number of found species is 162 with total number of 2282 records. List of species with particular results is given in appendix. Based on the finding is obvious that in most cases the ribosomal sequence is known and within 25 of these representatives it is also known their mitochondrial DNA and 3 of them has also sequenced the whole circular mitochondrial genome.

Klíčová slova

Gyrodactylus, Gyrodactylidae, molekulární markery, determinace, rRNA, mtDNA, GenBank, molecular markers, determination

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 7. 1. 2015

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 8. 6. 2015
• Vedoucí: Mgr. Iva Přikrylová-Potgieter, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Experimentální biologie / Molekulární biologie a genetika