Variabilita populací Plasmopara halstedii v ČR

Bc. Lucie SLOBODIANOVÁ

Diplomová práce

Variability of Plasmopara halstedii populations in the Czech republic

Anotace:

V diplomové práci jsem se věnovala charakterizaci patogenu Plasmopara halstedii, který je původcem plísně slunečnicové. Tato karanténní choroba se vyskytuje po celém světě a každoročně působí značné ekonomické ztráty ve výnosu slunečnice. V experimentální části diplomové práce byly metodou DSI ("drench seedling inoculation") identifikovány rasy u 13 izolátů P. halstedii pocházejících z území České republiky. V roce 2014 byly v populacích P. halstedii na našem území odhaleny rasy 70471, 71471, 71060 a dvě nové, doposud nezaznamenané, rasy 70571 a 71571. V další části práce jsem se zabývala výběrem polymorfních mikrosatelitových markerů pro studium patosystému Helianthus anuus-Plasmopara halstedii. Na podsouboru sedmi izolátů P. halstedii bylo testováno 112 publikovaných markerů, přičemž u 27 z nich došlo k detekci polymorfních PCR produktů, s počtem 2-4 alel na marker.

Abstract:

My thesis focused on characterization of oomycete pathogen Plasmopara halstedii, the causal agent of sunflower downy mildew. This quarantine disease is widespread and causes annual significant losses of sunflower yield. The experimental work included identification of P. halstedii races by a drench seedling inoculation (DSI) in the set of 13 isolates originating from the Czech Republic. In 2014 races 70471, 71060, 71471 complemented by two new virulence combinations 70571 and 71571 were identified in Czech populations of P. halstedii. In the last part, I performed selection of polymorphic microsatellite (SSR) markers with potential use in studies of Helianthus anuus-Plasmopara halstedii pathosystem. Alltogether 112 markers have been tested on the subset of seven P. halstedii isolates. As a result 27 polymorphic SSR marker were detected, where the number of alleles ranged from 2 to 4.

Klíčová slova

Diferenciační soubor, Helianthus annuus, mikrosatelitní markery (SSRs), plíseň slunečnicová, rasa, variabilita

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 29. 4. 2016

Zveřejnit od: 29. 4. 2016

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: doc. RNDr. Michaela Sedlářová, Ph.D.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární a buněčná biologie