Výskyt párovacích typů Fusarium circinatum v Galicii

Michael Melek

Bachelor's thesis

Abstract:

AbstraktFusarium circinatum Nirenberg & O'Donnell (teleomorf Gibberella circinata Nirenberg & O'Donnell) je houbový patogen způsobující rakovinu borovic (PPC). Jelikož tento celosvětově rozšířený a devastující patogen byl introdukován do Evropy, je veliký zájem o výzkum kvůli pochopení dalšího potenciálního vývoje infekce na kontinentě. V regionální míře představuje vzdušné inokulum F. circinatum jeden z hlavních způsobů šíření ochoření v lesních porostech, ve volné krajině, v městské zeleni a v školkách. V dnešní době se toto ochoření obyčejně nachází na místech s poměrně teplým podnebím a dostatečnou vlhkostí. Avšak předpokládaný vývoj patogenu pohlavním rozmnožováním může vést k vzniku nové rasy, která může být schopná infikovat v současnosti méně vhodné oblasti. Jelikož chceme zjistit, zda je možnost pohlavního rozmnožování v současných populacích PPC zjištěných v Evropě, tak jsme navrhli a následně testovali skupinu specifických primerov a hydrolytických prób pro F. circinatum na zjištění párovacích typů pomocí qPCR. Detekční metoda byla testována na vzorcích DNA extrahovaných z rotačních lapačů spór instalovaných pět krát na 48 h v přirozeně infikovaném lese PPC Monterey pine v Galicií (SZ Španělska).

Abstract:

AbstraktFusarium circinatum Nirenberg & O'Donnell (teleomorph Gibberella circinata Nirenberg & O'Donnell) is a fungal pathogen causing Pine Pitch Canker (PPC). Since this world-wide spread and devasting pathogen was introduced in Europe, a large research interest is emerging to understand the potential further progress of the infection in the continent. At a regional scale, the airborne inoculum of F. circinatum represents one of the main ways of spreading of the disease in forest stands, free landscape, urban greenery and tree nurseries. Nowadays, this disease typically occurs at sites with rather warm climate with sufficient humidity. However, putative development of the pathogen by sexual breeding may lead to a development of new races that may be able to infect currently less suitable areas. To find out whether there is a possibility of sexual breeding in current populations of PPC established in Europe we have designed and tested a set of F. circinatum mating type specific primers and hydrolysis probe for its qPCR detection. This detection method was tested on DNA samples extracted from tapes of rotating arm spore traps installed for five 48h samplings in naturally PPC infected forest of Monterey pine in Galicia (NW Spain).

Abstract:

AbstraktFusarium circinatum Nirenberg & O'Donnell (teleomorf Gibberella circinata Nirenberg & O'Donnell) je hubový patogén spôsobujúci rakovinu borovíc (PPC). Keďže tento celosvetovo rozšírený a devastujúci patogén bol introdukovaný do Európy, je veľký záujem o výskum pre pochopeniu ďalšieho potenciálneho vývoja infekcie na kontinente. V regionálnej mierke predstavuje vzdušné inokulum F. circinatum jeden z hlavných spôsobov šírenia ochorenia v lesných porastoch, vo voľnej krajine, v mestskej zeleni a v škôlkach. V dnešnej dobe sa toto ochorenie zvyčajne nachádza na miestach s pomerne teplým podnebím a dostatočnou vlhkosťou. Avšak predpokladaný vývoj patogénu pohlavným rozmnožovaním môže viesť k vzniku novej rasy, ktorá môže byť schopná infikovať v súčasnosti menej vhodné oblasti. Keďže chceme zistiť, či je možnosť pohlavného rozmnožovania v súčasných populáciách PPC zistených v Európe, tak sme navrhli a následne testovali skupinu špecifických primerov a hydrolytických prób pre F. circinatum na zistenie párovacích typov pomocou qPCR. Detekčná metóda bola testovaná na vzorkách DNA extrahovaných z rotačných lapačov spór inštalovaných päť krát na 48 h v prirodzene infikovanom lese PPC Monterey pine v Galícii (SZ Španielska).

Keywords

PPC, Pinus sp., Giberella circinata, území Evropy, devastující patogen

Keywords

PPC, Giberella circinata, Europe teritory, Devasting pathogen, Pinus sp.

Keywords

Pinus sp., Giberella circinata, PPC, územie Európy, devastujúci patogén

Language used: Slovak

Date on which the thesis was submitted / produced: 24. 4. 2019

Thesis defence

• Supervisor: Ing. Miloň Dvořák, Ph.D.
• Reader: Eliška Peňázová, Ing. Bc.

Mendel University in Brno

Faculty of Forestry and Wood Technology

Bachelor programme / field:
Landscape Architecture / Landscape Realizations